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薏苡(Coix lacryma-jobi L.)有着“世界禾本科之王”、“世界健康之禾”的美誉。薏苡为药、食两用植物,以薏苡中性油脂作主要成分的特效抗癌药“康莱特注射液”,是目前唯一一个获得美国FDA认可的中草药,现在已经进入Ⅲ期临床。薏苡作为小物种,NCBⅠ数据库目前没有它的基因组序列信息,由于缺乏优良的薏苡品种,加上国内很少人从事薏苡分子育种改良种质资源相关工作,造成薏苡胚油脂含量有效检测存在很大困难,缺乏有效检测方法和技术手段。本研究主要目的,是通过RAPD分子标记鉴定薏苡胚油脂性状,尝试找到控制薏苡胚油脂含量的分子标记并进行鉴定,并对所收集的23种薏苡(LG001~LG023)种质资源的遗传多样性进行分析,为改良薏苡胚油脂含量种质,对薏苡分子育种相关研究奠定基础。本论文通过RAPD分子标记技术对23个供试薏苡品种进行了遗传多样性分析,对胚油脂含量较高的薏苡品种进行了标记。从256条RAPD引物中筛选出来34条多态性丰富的RAPD引物,对23个供试薏苡品种基因组进行RAPD扩增,结果共获得405个多态性片段。采用UPGMA聚类分析法,以RAPD遗传系数0.75为标准,23种供试薏苡分为5类,第Ⅰ类包括LG012(黄白色)、LG004(棕色);第Ⅱ类包括LG013(黄白色)、LG015(黑褐色)、LG023(黄白色)、LG007(黑褐色)、LG009(黄白色)、LG014(黄白色)、LG002(黄白色)、LG022(黄白色)、LG005(黑褐色)、LG003(黄白色)、LG016(深棕色)、LG011(深棕色);第Ⅲ类包括LG021(棕色)、LG008(灰色);第Ⅳ类包括LG017(黄白色)、LG018(黑褐色)、LG001(深棕色);第Ⅴ类包括LG019(黄白色)、LG020(棕色)、LG006(深棕色)、LG010(黄白色)。这个实验结果与23份薏苡地理来源、种质系谱相符合。实验结果显示23份供试薏苡RAPD遗传系数相似,变幅值在0.55-0.96,LG013品种薏苡的遗传系数为0.87。LG013是这23种薏苡里面最优品种,在这23种薏苡品种中,LG013具有最大果长11.222mm,最大果宽10.148mm,最大果高8.194mm,最大种长10.69mm,最大种宽8.315mm,最大种高6.68mm,最大胚油脂含量0.00875g,最大胚含油脂百分数8.99%。LG013是23份薏苡中胚油脂含量最高的品种达8.99%,23份供试薏苡的胚油脂含量在1.75%-8.99%,平均值仅为3.47%。LG013在第400个多态性分子标记处,S44引物(序列信息TCTGGTGAGG)的扩增结果中1050bp处有唯一特异条带,其它品种薏苡1050bp均没有条带。据此设计特殊引物F:TCTGGTGAGGGG AGTCACA,R:TCTGGTGAGGCATGGTGT,利用特殊引物F/R分子标记鉴定结果表明,LG013有600bp特异性条带,引物F/R可用于LG013品种的鉴定及高含量胚油脂性状的分子鉴定。这些数据将会为薏苡种质资源改良研究,薏苡分子育种及薏苡其它重要性状研究提供一个新思路和新手段。