XRCC2基因SNPs多态性与结直肠癌关系的研究

来源 :泸州医学院 西南医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:fengwei27149
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目的:通过检测XRCC2基因C41657T G4234C单核苷酸多态性在结直肠癌(Colorectal Cancer,CRC)患者及正常对照者中的基因型及等位基因频率的分布,研究XRCC2基因C41657T G4234C SNPs与CRC易感性的关系,以及与CRC患者临床病理学参数之间的相关性;探讨C41657T多态性对XRCC2蛋白在CRC组织和正常组织中表达的影响。方法:采用病例-对照研究的方法,病例组为246例汉族结直肠癌患者, 对照组为同期体检健康者262例,抽取外周静脉血2ml,同时调查其个人资料、病史及临床病理学参数。使用酚-氯仿-异戊醇法提取外周血基因组DNA,采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism , PCR-RFLP)检测XRCC2基因C41657T G4234C SNPs的基因型及等位基因的分布,连锁不平衡与单体型分析用SHEsis在线软件进行,比较结直肠癌患者C41657T位点各基因型与肿瘤临床病理参数之间的关系。收集病例组结直肠癌肿瘤组织50例和正常大肠组织36例,免疫组织化学(Immunohistochemistry,IHC)技术检测肿瘤组织及正常组织中XRCC2蛋白的表达,卡方检验分析蛋白表达的差异。C41657T和G4234C各基因型与结直肠癌的患病风险采用logistic回归分析,计算相对危险度比值比(odds ratio,OR)和95%可信区间(95%confidence interval,95%CI)。采用SPSS11.5软件包进行统计,以P<0.05为有统计学意义。结果:(1)结直肠癌患者和对照组在性别、年龄、吸烟史、饮酒量无统计学差异;XRCC2基因C41657T及G4234C位点基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。(2)XRCC2基因C41657T位点CC、CT、TT各个基因型在病例组和对照组中的频率分别为63.4%、33.3%、3.3%和74.0%、23.3%、2.7%,两组间的基因型频率分布不同,差异具有统计学意义(P<0.05);C、T等位基因在病例组和对照组的基因频率分别为80.1%、19.9%和85.7%、14.3%,两组间比较有显著性差异(P<0.05)。XRCC2基因G4134C位点GG、GC、CC各基因型在病例组和对照组中的频率分别为67.5%、30.1%、2.4%和72.9%、24.8%、2.3%,两组间的基因型频率分布无明显统计学差异(P>0.05);G、C等位基因在病例组和对照组的基因频率分别为82.5%、17.5%和85.3%、14.7%,两组间比较无显著性差异(P>0.05)。(3)XRCC2基因 C41657T SNP与结直肠癌的发病风险相关:与CC基因型相比,CT合并TT基因型显著增加结直肠癌的患病风险(OR=1.646,95%CI=1.127~2.404),而C等位基因为个体患结直肠癌的保护性因素。XRCC2基因 C41657T SNP与结直肠癌的发病风险无关:与GG基因型相比, GC合并CC基因型不能增加结直肠癌的患病风险(OR=1.296,95%CI=0.885~1.898)。(4)应用SHEsis在线软件对XRCC2 基因C41657T和G4234C 两个SNP位点进行连锁不平衡及单体型分析显示, XRCC2 SNP间存在连锁不平衡现象( D=0.184, r2=0.032 , P=1.62e-8 )。XRCC2的4种单体型的分布在结直肠癌患者与正常对照组间具有显著性差异(χ2=11.189 , P=0.011 )。其中最常见的为41657C/4234G单体型, 41657T/4234G单体型在结直肠癌组的分布频率为7.3%,显著高于正常对照组的3.1%(χ2=10.236,P=0.002)。用非条件Logistic回归法分析显示,携带41657T/4234G单体型明显增加了结直肠癌的患病风险( OR=2.601 , 95%CI=1.421~4.758)。(5)结直肠癌患者中XRCC2基因C41657T位点的各基因型频率在肿瘤的组织学类型(腺癌、粘液腺癌)中的分布具有显著性差异(χ2=6.546,P=0.038),XRCC2基因C41657T位点的各基因型频率的分布与肿瘤的部位、大体类型、分化程度、浸润深度以及淋巴结转移等临床病理学参数间无明显差异(P>0.05)。(6)XRCC2基因C41657T位点多态性与其蛋白表达相关性显示:XRCC2蛋白在结直肠癌组织中的表达率为64.00%,与正常组织中的表达率30.56%相比,具有显著性差异(P=0.02)。同时,XRCC2蛋白表达在结直肠癌组织及正常对照组中的表达率也未见明显统计学差异(χ2=0.230,P=0.631和χ2=0.536,P=0.708)。结论:(1) XRCC2基因C41657T多态性与结直肠癌的患病风险相关,CT合并TT基因型能显著增加结直肠癌的发病风险;C等位基因是患结直肠癌的保护性因素。XRCC2基因G4234C多态性位点各基因型及等位基因频率在结直肠癌病例组和正常对照组中总体分布差异无统计学意义,与结直肠癌患病风险无相关性。(2) XRCC2基因C41657T多态性位点和G4234C多态性位点存在连锁不平衡;41657C/4234G单体型最常见,与41657C/4234G单体型相比, 41657T/4234G单体型明显增加了结直肠癌的患病风险。(3) XRCC2基因C41657T多态性位点与结直肠癌的肿瘤发生部位、分化程度、浸润深度及有无淋巴结转移和直肠癌组织学类型等临床病理学参数之间无相关性。(4) XRCC2蛋白的表达在结直肠癌标本和正常组织中具有显著性差异,XRCC2蛋白在肿瘤组织中高表达;XRCC2蛋白在结直肠癌组织和正常组织的表达与C41657T位点各种基因型无关。
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