自从2017年“乡村振兴”战略实施以来,振兴基层医疗仍然是“乡村振兴”战略实施过程中的较大短板,而提高乡镇卫生院服务效率正是振兴基层医疗的关键路径,可以有针对性地解决农村医疗服务质量差、发展相对缓慢等现实问题。为此,本文以2009年-2020年我国29个省、自治区、直辖市的面板数据为研究样本,采用DEA基本模型分析乡镇卫生院的服务效率情况,并在此基础上进一步通过Malmquist模型纵向评估乡镇卫生院的医疗卫生服务质量问题,最后对可能影响乡镇卫生院服务效率的环境因素采用固定效应模型。最后通过稳健性检验,得出影响乡镇卫生院服务效率的因素。研究结果指出,针对总体医疗卫生服务效率而言,西部地区＞中部地区＞东部地区。中部地区的服务效率并不稳定。从全国整体可以看,纯技术效率值一直大于规模效率值,即我们可以着重关注乡镇卫生院的资源分配情况,提高资源的利用率。乡村振兴背景下,乡镇卫生院的服务质量并没有明显的提高,未来应加大力度贯彻政策的落实与实施。通过对影响乡镇卫生院服务效率的因素分析,可知乡镇卫生院的数量、财政用于医疗卫生事业支出、乡镇工作机会、城镇化率、道路通达度和乡村经济发展水平对乡镇医疗卫生院的服务效率具有显着影响。未来可从因地制宜的改善乡镇卫生院相关外部环境因素、统筹乡镇卫生院的医疗卫生资源、提高农村地区居民对医疗资源的可及性三个方面入手,确保乡村振兴战略背景下,效率乡镇卫生院的服务质量有所提高。