在更加激烈的区域竞争形势下，区域创新能力能否得到提升成为区域竞争优势获取的关键。特别是2018年我国步入经济高质量增长阶段之后，创新驱动更是被提升到区域中长期发展战略上。作为继创新集群理论和创新体系理论之后的最新研究成果，区域创新生态系统理论在多元创新要素复杂融合的经济背景下，对于揭示区域创新活动规律、提升区域创新效率具有天然优势。　　有鉴于此，本文以区域创新生态系统为研究对象，就区域创新生态系统协同理论分析、协伺模型分析和协同实证分析三方面进行章节布局。首先，进行区域创新生态系统协同理论分析。在对创新生态系统相关理论研究进行综述的基础上，从内涵、结构和运行三个方面剖析创新生态系统思维的核心特质，并通过“生态系统-创新生态系统-区域创新生态系统”的概念演化路径，分析区域创新生态系统的协同本质，最终在对生态系统种群特征隐喻的基础上构建区域创新生态系统种群协同结构模型。其次，进行区域创新生态系统协同模型分析。将生态位宽度、共生演化以及耦合协同等概念引入区域创新生态系统演化过程分析中，设计出可以对区域创新生态系统主体间共生演化规律和创新主体与环境间耦合规律进行实证分析的生态位共生协同模型和生态位耦合协同模型。　　最后，进行区域创新生态系统协同实证分析。选择陕西省作为区域创新生态系统实证分析样本区域，对陕西省2011-2017年间区域创新发展实践状况进行分析，分别对陕西省区域创新生态系统整体适宜度发展水平、知识经济主体与商业经济主体之间的共生关系以及创新主体与创新环境之间的耦合及协调水平进行分析，发现陕西省区域创新发展过程主要存在以下问题：第一，就主体间生态位共生协同结果而言，陕西省知识经济创新种群主体与商业经济创新种群主体之间存在生态位竞争关系。这与陕西省近五年来经费支出提升，但新产品销售收入占比下降的实际情况相吻合；第二，就创新主体与创新环境间生态位耦合协同模型的耦合度结果而言，陕西省主体-环境处于磨合阶段，说明两者的创新资源供需关系状态还处于低度平衡状态；第三，就创新主体与创新环境间生态位耦合协同模型的协调度结果而言，创新主体与创新环境均处于高速度发展中，但是创新环境的发展速度相对比较落后，这使得两者低平衡的创新资源供需关系被进一步拉大。最后，针对这些既存问题，结合陕西省区域创新主体及创新环境的详细分析结果，提出陕西省区域创新生态系统协同发展措施。