目前在中国创业板上市的公司绝大多数为自然人控股公司,即自然人为第一大股东的公司。在这类上市公司中,又普遍存在自然人间接持股的现象,即自然人通过其控股公司间接持股上市公司。由于对自然人间接持股和公司绩效关系的研究相对较少,甚至为空白,本文旨在以创业板公司为例,从股权结构对公司绩效影响的角度,首先从理论上论述创业板上市公司中自然人间接持股的动机和目的,然后通过实证分析证明自然人间接持股对上市公司业绩的效应和影响。理论上的阐述分别从交易成本理论、委托代理理论、公司治理理论和行为理论等四个方面展开,来研究自然人间接持股的动机和效应；实证分析以我国创业板183家上市公司为统计样本,通过描述性统计分析、单因素分析和回归分析最终建立多元线性回归模型,其中选取了创业板上市公司总资产报酬率、营业利润率、净资产收益率、每股收益和每股净现金流等5个变量作为度量公司绩效的被解释变量,分别建立回归模型,得出了自然人间接持股比例与总资产报酬率成反比、与其他绩效变量没有具有统计学意义的线性相关性的基本结论。