84K杨HD2亚家族基因的克隆与表达分析

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表观遗传学是当今生物学领域研究的一个热点,而组蛋白修饰是表观遗传学研究的一个重要内容。本文通过PCR的方法获得84K杨中HD2亚家族三个基因的基因序列,分别命名为84KHDT901、84K HDT902和84K HDT903。通过生物信息学的方法对这三个基因进行了全面分析,结果表明84K杨HDT901、HDT902和HDT903分别编码长度为276aa、274aa和305aa的蛋白质;亲疏水性分析显示该家族蛋白为为亲水性蛋白;结构域分析表明在HD2亚家族的C端有一个典型的锌指结构,可能与识别结合染色体DNA相关;二级结构分析表明HD2亚家族蛋白不含有α-螺旋,只有β-折叠和无规则卷曲两种二级结构,跨膜分析显示HD2亚家族蛋白不含有跨膜螺旋。亚细胞定位分析表明84k杨HD2亚家族三个成员定位于细胞核内。采用real-time PCR的方法分析了84K杨HDT901、HDT902和HDT903基因在不同器官中的表达。结果表明,三个基因在根、茎和叶中均表达,其中在叶片中表达量最高,根中表达量最低。此外,分析了84KHD2亚家族三个基因在不同胁迫下的表达,实验结果表明,总体上盐胁迫和甘露醇抑制HD2亚家族基因的表达,短期处理(6h或12h)会使这些基因的表达略有上升。低温处理初期HD2亚家族基因的表达上调。HDT9O1和HDT902在大多数器官内表达模式相同,而HDT903与前两者有不同的表达模式。这些研究表明,84K杨HD2亚家族三个成员的表达受盐、干旱和低温胁迫的调节。
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