公安机关的司法鉴定作为一项证明活动,其产生的鉴定意见或鉴定结论能够直接为诉讼裁判提供证据,影响裁判的质量,甚至在某些情况下对整个案件的公正审判起到了决定性的作用。但不论是在理论研究领域,还是在实际运行中的实践领域,关于公安机关司法鉴定和公安机关司法鉴定制度的争议和问题始终存在。这些问题不仅阻碍了公安机关司法鉴定制度的发展,最终也影响了司法公正的实现和司法改革的进程。因此,从研究公安机关司法鉴定的法理学基础理论的本源性问题出发,探求解决现实问题的办法,探索一条符合中国实际国情的改革和创新之路,是摆在当今公安机关司法鉴定制度改革面前一个迫切而又现实的要求。长久以来,对于我国司法鉴定制度进行理论研究和实证改革探讨的学者颇多,逐渐形成了统一的系统化的研究成果。但对于公安机关司法鉴定制度这一特殊研究对象,国内外的学者却仅在“公安司法鉴定与刑事科学鉴定的异同”、“公安机关是否存在‘自侦自鉴’问题”、“公安机关内部是否应设立司法鉴定机构”等表面的现象问题上进行争论,却忽视对公安机关司法鉴定的理论本质问题进行分析,这也是造成学理不清、争议不停的重要原因。分析公安机关司法鉴定的法理学价值,探讨在效率、正义、秩序、民主、理性价值取向下公安机关司法鉴定的应然状态,不仅是开展其他理论、实证研究的基础,更为构建理想公安司法鉴定制度提供指导依据。同时,通过实证调查研究,分析现行公安司法鉴定制度的现状,从鉴定人、鉴定机构、鉴定流程、鉴定监督等方面对其内部存在的问题进行深刻剖析。同时通过对国外警察机构内部设置的司法鉴定机构体制和运行制度进行比较研究和对本国改革试点省份的先进经验分析后,我们可以得到指导现实改革的成功范例和三条指导性原则。基于此,提出了推进专门立法、加强公安机关司法鉴定机构的去行政化、完善公安机关司法鉴定的程序控制和管理制度等解决问题的办法,辩证才能施治,以期抛砖引玉,得到大家的共鸣和认可。