猪繁殖与呼吸综合征病毒(TJ株)分离鉴定及其ORF5基因序列分析

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猪繁殖与呼吸综合征(PRRS)是由猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)引起的一种以母猪繁殖障碍和仔猪呼吸道疾病为特征的传染病。该病自1987年在美国首次发现以来,迅速遍及世界各地,给全球的养猪业带来了巨大的经济损失。PRRSV的遗传变异广泛分布于整个基因组中,其中ORF5基因是变异最大的基因之一,因此对ORF5基因的变异分析可以为探讨整个基因组的遗传变异规律提供一定的依据。本研究从天津某猪场出现高热症状病猪所采病料中分离到1株病毒,该病毒能在Marc-145细胞上增殖,产生稳定的细胞病变,以圆缩、聚集、脱落为特征。经间接免疫荧光试验和RT-PCR方法证明该病毒为美洲型PRRSV,将其命名为PRRSV TJ株。动物回归试验结果显示,经Marc-145细胞传至第3代的TJ株(病毒滴度为104.5 TCID50/ mL)人工感染仔猪后试验动物5/5发病,3/5死亡,说明TJ株的致病力较强。根据ATCC VR-2332的ORF5基因设计特异性引物,对PRRSV TJ株在Marc-145细胞上传至第3代、第51代和92代病毒的ORF5基因进行RT-PCR扩增,将扩增的cDNA片段克隆入pMD 18-T载体并测序,得到PRRSV TJ株F3代、F51代和F92代病毒的ORF5基因序列。序列分析结果表明,PRRSV TJ株F3代ORF5基因核苷酸序列与美洲型代表毒株VR-2332的同源性为89.4%,与欧洲型代表毒株LV的同源性为63.5%。与其他美洲型毒株的同源性在88.1%~100%之间,与其他欧洲型毒株的同源性在62.5%~63.7%之间。根据ORF5基因序列绘制了PRRSV的系统发育树,由进化树可见, PRRSV TJ株位于美洲型毒株的分支,与HB-1(sh)/2002、CH-1a、HB-2(sh)/2002和PRRSV高致病性毒株HUB1、HUB2、HEB2、HUN4、NM1、GD、SHH、JXA1的亲缘关系较近,属于同一个亚群。序列比对发现, TJ株F3代、F51代和F92代病毒ORF5基因推导的氨基酸序列在23aa、80aa、128aa、151aa、196aa 5处氨基酸位点发生变异。其中在毒力相关位点151aa处,由TJ株F3代的R突变为F51代和F92代的K。蛋白特性分析发现,TJ-F3代的GP5蛋白有3个跨膜区,而TJ株F51代和F92代的GP5蛋白只有2个跨膜区。151位氨基酸位点突变及跨膜区的改变可能与PRRSV TJ株在传代过程中致病性减弱有关。
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