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小麦黄花叶病（Wheatyellow mosaic，WYM）是由小麦黄花叶病毒(Wheatyellowmosaic bymovirus，WYMV)引起的一种土传病毒病害，在冬小麦种植区经常发生，正日益成为危害我国小麦生产的最严重的病害之一，危害小麦安全生产．抗WYMV基因资源的挖掘和深入研究对于小麦抗病毒育种具有重要意义．
‘西风小麦’是自日本引进的早熟抗病优良品种，具有抗倒伏、白粉病、赤霉病、条锈病、穗发芽和高抗WYMV等优异性状．在我国，育种工作者利用‘西风小麦’作为骨干亲本直接或间接育成了一些广泛推广的优良品种，如‘宁麦9号’、‘宁麦16号’和‘扬麦18号’，这些品种也高抗WYMV。‘镇9523’是江苏丘陵地区镇江农科所育成的综合性状优良的品种，具有矮秆茎粗、穗大粒多、粒重高、粒型好，中抗赤霉病、叶锈病、纹枯病等优异性状，但高感WYMV。本研究以‘西风小麦×镇9523’重组自交系群体构建了分子标记连锁图谱，在此基础上，结合WYMV抗性、株高、穗长和每穗小穗数等4个性状的考察和鉴定，进行QTL分析，为小麦育种提供新的基因资源。研究还针对鉴定出的一个抗WYMV主效QTL QYm.nau-5A.I，构建次级F2分离群体进行精细定位，为图位克隆分离该主效QTL奠定重要的基础。
1．抗WYMV QTL分析和主效QTL QYm.nau-5A．I的精细定位
应用植物数量性状主基因+多基因混合遗传模型对WYMV抗性进行遗传分析，结果表明，WYMV抗性的遗传在四个试验环境中符合2或3对主基因+多基因混合遗传模型，主基因的遗传率为81.00-93.93％，多基因的遗传率为5.55-17.17%。
利用覆盖小麦全基因组的1790对SSR、STS、EST-SSR和EST-STS标记在‘西风小麦×镇9523’RIL群体双亲之间进行多态性筛选，选取在双亲及群体中多态性较好且带型清晰的317个标记，利用JoinMap4.0软件进行分子标记连锁图谱的构建，271个标记的274个位点组成了33个连锁群，连锁群总长度为1685.3cM，标记位点间的平均距离为9.8cM，覆盖小麦的21条染色体。在此基础上，结合群体四个环境的WYMV抗性鉴定结果，利用Windows QTL Cartographer V2.5软件的复合区间作图法对WYMV抗性进行QTL定位，共检测到3个新的抗WYMV QTL: QYm.nau-3B.1．QYm.nau-5A.1和QYm.nau-7B.1，分别位于染色体3BS、5AL和7BS上．抗病等位基因均来自抗病亲本‘西风小麦’，其中QYm. nau-3B.I和QYm.nau-5A.1在四个环境中均被检测到，分别解释3.3-10.2%和25.9-53.7%的表型变异；而QYm.nau-7B.1仅在试验环境E1中被检测到，解释4.9%的表型变异．
根据抗WYMV QTL分析的结果，在RIL群体中选择一个仅含有QYm.nau-5A.1且其他农艺性状和镇9523相似的高抗家系与镇9523杂交，构建了一个包含6002个单株的次级F2分离群体来精细定位QYm.nau-5A.1，经重组体筛选将QYm. nau-5A.I定位于标记Xwmc415.1和5EST-440之间，且2个EST-STS标记5EST-44和5EST-90与QYm.nau-5A.1表现出共分离。连锁分析表明，标记Xwmc415.1、5EST-44和5EST-90与QYm. nau-5A.I之间的遗传距离均为0.0cM，标记5EST-440与QYm.nau-5A.1之间的遗传距离为0.1cM。最终将QYm.nau-5A.1定位于0.1cM的标记区间Xwmc415.1-5EST-440内，为图位克隆分离QYm.nau-5A.I奠定了的基础。
利用与QYm.nau-5A.l紧密连锁的3个标记Xwmc415.1、5EST-44和5EST-90对WYMV抗性已知的46个品种组成的小麦品种群体进行分子标记分析，结果在10个抗WYMV品种中检测到QYm. nau-5A.I，且这3个标记在所有12个感WYMV品种中均扩增出和感病品种‘镇9523’一致的与感病相关的带型．因此，这3个标记在小麦品种群体中能够对QYm.nau-5A.1进行有效地鉴定，可用于抗WYMV MAS育种。
2．三个重要农艺性状的QTL分析
应用植物数量性状主基因+多基因混合遗传模型对株高、穗长和每穗小穗数等3个农艺性状进行遗传分析，结果表明，株高、穗长和每穗小穗数性状的遗传在两个试验环境中均符合2对主基因+多基因混合遗传模型。
在构建分子标记连锁图谱的基础上，结合群体两个环境目标性状的考察结果，利用Windows QTL Cartographer V2.5软件的复合区间作图法对3个农艺性状进行QTL定位，共检测到4个与株高相关的QTL: QPh.nau-2D、QPh. nau-3RI、QPh.nau-4B和QPh.nau-4D．分别位于染色体2DS、3BL、4BL和4DS上．其中QPh.nau-2D．QPh.nau-4B和QPh.nau-4D在两个环境中均被检测到，可分别解释7.4-7.9%、29.3-30.3%和28.3-35.6%的表型变异。共检测到5个与穗长相关的QTL: QSl.nau-2D.a、QSI. nau-2D,b，QSl.nau-5A.I、QSl.nau-5B和QSl.nau-6B，分别位于染色体2DS、2DS、5AL、5BS和6BL上．其中，QSl.nau-2D.a、QSl.nau-2D.b和QSI. nau-5A.I在两个环境中均被检测到，可分别解释20.6-29.0%、5．O%和8.8-11.6%的表型变异。共检测到5个与每穗小穗数相关的QTL: QSn.nau-lA.I、QSn.nau-5A.l.a、QSn.nau-.5A. l.b、QSn.nau-SD和QSn. nau-6B，分别位于染色体1AS、5AL、5AL、5DL和6BL上．其中，QSn. nau-1A．I和QSn.nau-5D在两个环境中均被检测到，分别解释10.2-11.1%和7.8%-11.9%的表型变异。