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马鹿是我国II级重点保护野生动物,本次实验选取的研究对象为阿拉善马鹿,仅生存在我国贺兰山中段。研究表明,宿主肠道菌群结构和多样性的变化受季节的影响,本文意在分析季节变化对野生阿拉善马鹿肠道菌群的影响。阿拉善马鹿为反刍动物,结合其不同季节的食性特点,分析其肠道菌群结构和多样性差异的原因。通过对不同季节野生阿拉善马鹿肠道菌群的对比分析,帮助我们更有针对性的对野外阿拉善马鹿进行保护。本文通过16S rRNA测序技术,对冬、夏季阿拉善马鹿肠道菌群的结构和多样性进行比较。结果如下:1、40个阿拉善马鹿粪便样品共注释到32个菌门,49个菌纲,51个菌目,78个菌科和122个菌属。共获得10576个OTU,其中冬季组和夏季组分别有7790、8049个OTU、两组共同拥有5263个OTU。2、阿拉善马鹿的肠道菌群中,厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和变形菌门(Proteobaoteria)为优势菌门;梭菌纲(Clostridia)、拟杆菌纲(Bacteroidia)和γ-变形菌纲(Gammaproteobacteria)为优势菌纲;梭菌目(Clostridiales)、拟杆菌目(Bacteroidales)和假单胞菌目(Pseudomonadales)为优势菌目;疣微菌科(Ruminococcaceae)、毛螺杆菌科(Lachnospiraceae)和拟杆菌科(Bacteroidaceae)为优势菌科;Sporobacfter、拟杆菌属(Bacteroides)和梭菌属(Clostridium)为优势菌属。3、冬季和夏季两组阿拉善马鹿的肠道菌群多样性具有明显差异。样品从冬季转变到夏季时发现,在门水平上,厚壁菌门相对丰度降低,拟杆菌门和变形菌门的相对丰度增加;纲水平上,梭菌纲(降低)和拟杆菌纲(增加)为两个季节的共同优势菌纲,冬季和夏季组的第三优势菌纲分别为β-变形菌纲(增加)和γ-变形菌纲(降低);目水平上,梭菌目(降低)和拟杆菌目(增加)为两组的共同优势菌目,冬季和夏季组的第三优势菌目分别为伯克氏菌目(Burkholderiales)(增加)和假单胞菌目(降低);科水平上,优势菌科为疣微菌科,毛螺菌科和拟杆菌科,三者的相对丰度均降低;属水平上,优势菌属为Sporobacter和梭菌属,两者的相对丰度均降低,拟杆菌属的相对丰度升高。4、α多样性分析得到,冬季组肠道菌群的多样性高于夏季组。β多样性分析得到,冬季组肠道菌群组间相似性高于夏季组;马鹿冬季组的肠道菌群结构与夏季组之间有一定程度的相似性,但两组之间存在明显的分离现象。