新不列颠海沟可培养细菌多样性及一株新型耐冷菌Parasedimentitalea marina W43T的分类鉴定与耐冷机制初步研究

来源 :上海海洋大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:kawwq
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
海洋约占地球总面积的71%,其中深海占据整个海洋的绝大部分,海洋作为地球上最大的生态系统,拥有丰富的微生物资源,然而对其研究仍处于初级阶段。深海因其具有低温、高压、寡营养、无光照等特殊环境特点,极端的环境孕育了特殊的微生物群落结构。因实验室难以模拟复制真实的海洋生态环境,使得实验室条件下可培养的微生物数量与海洋中实际存在的微生物数量之间差距悬殊,这成为研究微生物、认识海洋、深入开发利用海洋资源的一个障碍。基于复杂的海洋环境,在对海洋微生物进行分离培养时,可根据微生物自身特性和其特殊生存环境特点,设计与生存环境相似的培养条件和培养方法来提高海洋微生物的分离培养效率。还可以利用多种分离培养方法、培养技术相结合的手段,同时综合考虑微生物未被培养的原因以及微生物可培养的影响因素,从而进一步提高海洋可培养微生物的数量,使更多的微生物能够实现实验室条件下的分离培养,加深对海洋微生物的研究应用。本研究从新不列颠海沟采集的24个海水和沉积物样品中共分离获得131株细菌,这些菌在归类上隶属于4个门、6个纲、16个目、31个科、59个属,131个种。在门的分类水平上,放线菌门(Actinobacteria)17株菌,占分离细菌总数的13%;拟杆菌门(Bacteroidetes)8株菌,占分离细菌总数的6%;厚壁菌门(Firmicutes)21株菌,占分离细菌总数的16%,变形菌门(Proteobacteria)85株菌,占分离细菌总数的65%。在变形菌门中,从菌种数量上看,γ-变形菌纲(Gammaproteobacteria)菌种多样性最丰富,有53株菌,α-变形菌纲(Alphaproteobacteria)30株菌,β-变形菌纲(Betaproteobacteria)2株菌。优势属为Alcanivorax、Bacillus、Halomonas、Marinobacter、Microbacterium、Pseudomonas、Qipengyuania、Thalassospira等8个属,其中Alcanivorax属6个种,Bacillus属8个种,Halomonas属8个种,Marinobacter属10个种,Microbacterium属9个种,Pseudomonas属10个种,Qipengyuania属5个种,Thalassospira属4个种。从多个角度对分离到的这131株菌进行了多样性分析。本研究从新不列颠海沟W站位海水样品(149.8°E,7.0°S,水深4000米)中分离获得一株新型耐冷菌株W43T,16S r RNA基因序列与Sedimentitalea nanhaiensis DSM 24252T相似性最高,为96.5%。基于16S r RNA基因和全基因组的系统发育分析显示,菌株W43T与红杆菌科(Rhodobacteraceae)内的其他属处于平行关系,形成了一个独立的进化分支。菌株W43T是革兰氏阴性菌,好氧,细胞形态为无鞭毛的杆状,最适生长温度为16-20°C,最适生长p H为6.5-7.0,最适生长盐度为2%。菌株W43T的主要脂肪酸为C18:1ω7c/C18:1ω6c,主要呼吸醌为泛醌10,主要极性脂有磷脂酰乙醇胺、磷脂酰甘油和二磷脂酰甘油。基因组全长5080 916 bp,包含一条环状染色体和四个环状质粒,G+C含量为55.9 mol%。基因组初步分析表明,菌株W43T拥有不饱和脂肪酸合成、PHA合成、甜菜碱等相容性溶质合成转运等低温适应相关基因,初步显示出其适应深海低温环境的分子基础。基于表型、化学组分和生理生化特性综合分析表明,菌株W43T是代表红杆菌科(Rhodobacteraceae)的一个新属,命名为Parasedimentitalea marina gen.nov.,sp.nov.,模式菌株为W43T=MCCC 1K03532T=KCTC 62635T。本研究揭示了新不列颠海沟样品中可培养细菌的多样性,对其进行了多维度的多样性分析,并通过细菌新种鉴定实验确立了一个新属Parasedimentitalea Marina W43T在细菌分类学上的地位。研究结果既丰富了海洋微生物资源库菌种目录,对我们进一步了解新不列颠海沟微生物资源多样性尤其是可培养细菌多样性也具有一定指导意义,同时能帮助我们更好地理解微生物在海洋物质能量循环中的作用,认识神秘的海洋世界。
其他文献
通过积年累月的实践经验,我们可以看出,在社会经济进一步发展壮大的今天,耗用能源的数量逐渐增加,对于电力的依赖程度也在不断提高,依照相关统计数据我们不难发现,在所有的消费能源中,电力所占的比重普遍偏高,在发达国家或地区所占比重已经突破70%。海南省电力市场建设起步相对较晚,是我国最后一个开展电力市场化交易的省份,2018年底才完成真正意义上的第一次市场化电力交易,市场交易电量总量为2亿千瓦时,尚不足
学位
大薯(Dioscorea alata L.)是重要的热带块茎类作物,产量高,适应性强,营养价值丰富。但是,大薯的块茎形态变异较大,有的基因型的大薯地下块茎往往深达一米,采挖极其困难,不利于大规模机械化采挖,获得直条形且块茎粗短的大薯新品种是大薯重要的育种方向。在前期的研究中发现:Dioscorin蛋白与大薯块茎的形态发育有关,Da-dio5基因是控制大薯Dioscorin蛋白合成的关键基因。为了进
学位
作为对社会价值与利益的权威性分配,公共政策的形成过程实际上是政策主体根据各利益集团需求,对复杂利益进行调整的过程。[1]在当前社会风险全球化背景下,尽管各类公共政策对于解决社会问题,推动改革发展发挥了不可替代的作用,但在政策推行的背后也存在着社会风险。政策实施的目的在于解决现实问题,但在实际施行过程中,由于社会环境的改变,各种主客观因素的影响,政策推行过程中不可避免的会面临各类风险,引发社会问题。
学位
21世纪的竞争,本质上是以科技创新为核心的全面创新能力的竞争。科研院所作为国家科技创新的重要主体,承担着推进国家科技发展的重要职责,但我国的科技与生产相脱节的情况长期存在。随着创新驱动战略的深入实施,科研机构创办衍生企业演变成为重要的科技成果产业化方式。现实中,科研机构的衍生企业在创建初期往往获得大量来自母体组织的资源支撑,这导致了衍生企业嵌入在母体组织的内部网络当中。但在追求自主发展的过程中,衍
学位
城投公司是我国特色社会主义市场经济建设到一定时期、实现城市化发展目标的核心关键点,它的产生对极大推动了我国经济水平提高。但近几年城投公司不断发展壮大,也出现了诸如负债、偿债能力大等诸多突出的问题。在这样的背景下,推动城投公司转型可谓是刻不可缓、大势所趋。海口市CT公司集团作为目前海口市最大的综合性政府平台投资公司之一,于2003年成立,主要的职能为项目融资、政府平台投资项目的建设与管理、房地产项目
学位
当前数量众多的中小微企业已成为我国国民经济发展、现代社会运行的重要力量。推动中小微企业实现良好发展,是保持国民经济平稳运行的关键保障,是关系国计民生、拓宽民众就业渠道、维系社会稳定的重要一环。但是小微企业融资难融资贵依然是困扰其生存与发展的瓶颈,尤其是2020年受新冠疫情的影响,小微企业更是步履维艰,难上加难。如何助力小微企业脱困,国家银保监局相继出台了商业银行小微企业金融服务监管评价办法,力求降
学位
随着农业经济的不断快速发展,我国的农业行业也逐步向实现现代化迈进,农业企业的经营模式也发生了很大的变化,传统经营的农业企业也越来越少。近年来,多元化经营方式在我国农业上市公司中获得了较多的青睐,这无疑给我国农业行业带来了新的生命力,改变了农业上市公司的经营模式,影响了公司的经营绩效。由于多元化经营战略可以分散由经营单一业务带来的一些风险,以及其他一些客观存在的风险,所以越来越多的农业上市公司选择多
学位
这两年,在全球经济缓慢发展甚至停滞不前的大环境下,商业银行公司不良贷款迅速增长,个人贷款业务成为银行利润稳增长的支点,所以对个人贷款业务风险管理的研究成为商业银行实现战略发展的关键。目前个人贷款业务受到中美关系反复、世界经济下行特别是新冠疫情的持续影响,包括个人经营贷款、个人消费贷款在内的业务都呈现增长乏力的迹象,只有个人住房按揭贷款占比在不断提升。随着2020年上半年LPR利率下行、央行货币量化
学位
操作风险在商业银行风险体系中占着中心轴的作用,与各大风险有着千丝万缕的关系,是商业银行正常经营管理的基石。随着银行风险管理内容不断完善,柜面操作风险管理研究在商业银行风险管理研究中有着不可估量的地位。在实际经营中,柜面操作风险管理逐渐被银行经营者重视,比如他们会重视因为柜面不当操作引起的客户投诉、流失存款,进而害怕影响银行声誉,故形成一套详细有实践性的柜面操作风险管理体系对银行经营者而言迫在眉睫。
学位
近年以来,经济发展形势复杂万变,市场需求变化日新月异,互联网技术飞速发展,国内的银行业正上演着一场深刻、快速的变革,其中零售金融业务已成为银行激烈竞争的一个重要领域,而信用卡作为银行业零售金融的核心业务之一,对于银行业的发展起着至关重要的作用。随着金融技术创新赋能,数字化在金融领域广发应用,使得信用卡的运营效能、客户体验、风险管理等方面不断提升。本文针对信用卡营销策略进行优化,在于帮助银行制定更为
学位