随着我国高校管理体制改革的不断深入，内部控制在高校运行管理中的作用越来越突显，已成为必不可少的管理工具和手段。然而，我国高校内部控制建设起步比较晚，内控机制还不健全，目前还存在着“缺少有效监督、控制制度不健全、信息与沟通不顺畅”等诸多缺陷，这些缺陷的存在，限制了高校内部控制有效地发挥作用。近年来，经济犯罪案件频频发生，不仅给国家带来了重大的经济损失，在社会上也造成了恶劣的影响，而且严重损害了高校的声誉。为了改善高校的内部控制现状，本文借鉴COSO内部控制新框架的基本理论，参照《行政事业单位内部控制规范（试行）》的要求，结合我国高校教育事业发展的特点和具体实际情况，以国内高校内部控制建设问题作为探索和研究的主要对象，采用文献、规范和案例分析相结合的方法，对内控理论进行了科学、系统的论述，提出了我国高校内部控制建设的建议和策略。希望有助于对高校的内部控制建设进行有益的探索，帮助高校进一步健全和完善内部控制体系，保证内部控制的有效运行，防范和遏制舞弊、腐败行为的发生，进而提升高校的运行管理水平。