基于茶树鲜叶离体失水转录组的CsSnRK2s和CsADC基因鉴定与功能分析

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茶树是我国重要的经济作物之一,持续的干旱、低温等非生物胁迫都会影响茶叶的产量和品质,为了筛选茶树与抗旱性相关的重要基因并进一步解析失水逆境信号转导调控的分子网络,本研究通过茶树鲜叶离体失水转录组测序分析,锁定了ABA信号转导通路中的重要蛋白激酶SnRK2s以及多胺代谢关键酶精氨酸脱羧酶(ADC),并进一步通过酵母双杂交检测二者分别与转录因子CsICE1的互作关系,同时采用qRT-PCR测定了离体失水条件下,不同茶树品种中以上基因的表达情况,得到的主要研究结果如下:1、通过茶树鲜叶离体失水转录组数据分析发现,获得的测序数据拼接质量较高,clean data共计104.12 G,unigene共计233131个。其中值得关注的是,差异基因KEGG富集分析发现:ABA信号转导通路相关基因在茶树鲜叶离体失水3 h、12 h和24 h时均显著上调表达。2、在“鄂茶1号”茶树品种中,克隆获得CsICE1、CsSnRK2.1、CsSnRK2.6、CsSnRK2.8和CsADC 5个基因的cDNA序列,生物信息学分析结果表明:5个基因的ORF分别为1587 bp、1077 bp、1027 bp、1035 bp和2163 bp;编码氨基酸数目分别为:528、358、342、344和720;疏水性和跨模性分析结果表明:这5个基因编码的蛋白质全部都为亲水性蛋白质,且均不跨膜;系统进化树表明,CsSnRK2的3个成员分别属于CsSnRK2亚家族的三组;CsADC与番木瓜CpADC的同源性较高;多序列比对分析和蛋白质结构域预测分析结果表明:CsICE1包含bHLH结构域,CsSnRK2s包含Ser/Thr结构域,CsADC包含Orn-DAP-Arg-deC结构域和Orn-DAP-Arg-2吡哆醛-脯氨酸结合位点;蛋白质二级结构的结果表明:CsICE1、CsSnRK2s及CsADC均由ɑ-螺旋、延伸链、β-转角和无规则卷曲构成;磷酸化位点分析表明:CsICE1、CsSnRK2s及Cs ADC均具有多处Ser、Thr和Tyr磷酸化位点;亚细胞定位在线预测分析结果表明:CsSnRK2s主要存在于细胞质和细胞核,CsICE1主要存在于细胞核,CsADC主要存在于细胞质。3、酵母双杂交实验结果表明:转录因子CsICE1全长具有自激活性,短截片段CsICE1-73和CsICE1-146均不具有自激活性,且与CsSnRK2.6和CsADC均不发生互作。4、相对表达量分析结果表明:CsSnRK2.1、CsSnRK2.8、CsICE1和CsADC在4个品种中经脱水胁迫处理后,其上调基本不超过3倍,下调不低于原来的1/3。但CsSnRK2.6的相对表达量在黔辐4号中上调最为明显,脱水胁迫处理3 h后,CsSnRK2.6的表达量就上调超过了5倍,脱水胁迫处理9 h时,其表达量就上调超过了16倍,但在脱水胁迫处理12 h后,其表达量呈下调趋势,且下调量不明显,而在鄂茶10号、紫娟和鄂茶1号中,CsSnRK2.6的上下调表达量基本不太明显。
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