随着全球经济合作带来的一体化趋势，跨境合作成为区域合作的焦点。中国边疆建设的大背景使得跨境合作越来越具有普遍意义,然而我国当前跨境合作的经验积累还处于欠缺阶段，对于边境地区在跨境合作中的任务、作用、发展策略都还需进一步科学认识，论文针对这一问题对跨境合作的阶段、特征进行分析，并以云南跨境地区的合作为实证，研究我国边境地区的跨境合作问题。论文运用综合的视角、数据分析与实际调研相结合等研究方法，首先在文献研究的基础上提出了跨境合作的五大假说，其次通过国际案例研究跨境合作中的一般规律；第三，以云南跨境合作为例，分析其具有的时代特征，并且客观评价其在跨境经济区、地缘安全、国际环境、自然生态、社会联系、资源开发五个方面的跨境合作进展；最后，针对云南跨境地区各类合作情况的优劣，以及跨境地区呈现出来的空间格局特征，提出基于云南跨境地区的跨境人居假说的构建，明确跨境地区这一特殊人居环境建设的原因、特性、定位、基础及内容，并对云南跨境地区合理的发展策略提出具体操作建议。论文通过研究得到以下主要结论：1）跨国经济区联系、地缘政治安全利益、国际环境、跨境自然社会系统、资源开发是跨境合作的五个主要原因，并且体现在已有的国际案例中；2）跨境合作与边境两侧封锁性、经济发展水平有显著关系，且在跨境合作的不同阶段具有各自不同的合作重点；3）跨境合作中的边境优势能否发挥具有不确定性，对于边境城镇的影响也会呈现多种形式；4）从经济发展、地缘政治、国内资源供给、对外转口贸易、对外经济模式来看，云南跨境地区合作具有时代必然性；5）在跨境成效检验方面，云南跨境地区在中国-东盟经济中的作用及未来发展都有限，鉴于这一地区在资源开发、文化生态、地缘政治安全方面的特殊性，应该调整发展战略；6）云南跨境人居建设是基于云南“非经济因素主导的跨境合作”而提出的，云南跨境人居建设应该在次区域和跨境地区两个层面上开展，合作应该以边境经济区建设、跨境发展走廊建设、生态环境保护为主，在人居环境建设中强化经济区与基础设施建设，强化文化生态体系建设。