2019年年底开始,一场席卷全球的新冠肺炎疫情突然爆发,在短短两年的时间内冠状病毒发生多次变异,严重危害全球各国人民生命健康安全,对各国社会稳定和经济发展带来了巨大压力。面对此类突发公共卫生事件的发生,我国各级政府迅速集中力量拨付大量专项财政资金和应急救援物资至受灾地区并积极出台相关优惠政策,社会公众积极参与社会捐赠,全国上下万众一心共同努力早日恢复社会秩序。在面对巨额财政专项拨款资金和巨大数量的捐赠物、应急物资的情况下,如何快速通过国家审计制定专项审计计划、实现财政与物资的精准拨付、落实政府临时出台的优惠政策和复工复产制度是各级审计机关面临的重点和难点问题。在突发公共卫生事件审计过程中,审计的理念和方法在不断发生变化,本论文结合PSR（压力-状态-响应）模型对突发公共卫生事件的特点进行分析与总结,通过对当前审计实施的内容进行现状分析和问题汇总,在此基础上依据审计实践设计更符合突发公共卫生事件的审计制度内容并结合X市具体情况进行应用研究,以更好的发挥国家审计在特殊时期的治理作用。本文研究结论为突发公共卫生事件审计因为其自身特殊的时效性和综合性要积极结合事件自身特点、灵活运用应急处置审计方法形成全方位、多层面的审计模式,积极提升常态化审计意识和加强审计信息化建设,注重突发公共卫生事件审计制度的合理运行,最终更好的实现维护广大人民群众的生命健康财产安全。本文的研究贡献是基于PSR模型构建多阶段、分目标、多方法的突发公共卫生事件“常态化预防审计+非常态化专项审计”的理论框架,在总结审计阶段和重构审计流程的基础上创新审计模式,同时将大数据技术运用到突发公共卫生事件审计中,通过搭建大数据审计平台和评估社会公共安全状态,建立基于地方政府审计的预警制度和运行机制,帮助地方政府将风险治理、清单管理等嵌入到制度建设当中,构建新的审计蓝图,树立地方政府威信,实现突发公共卫生事件审计制度的不断优化,有效发挥审计监督作用。