专利行政执法是我国知识产权保护制度的重要内容。经过三十多年的实践和发展,专利行政执法的优势日益凸显,执法绩效日益显著,已成为我国激励创新和促进技术进步必不可少的制度工具。当前,我国经济发展进入新常态,有效发挥专利行政执法优势来激励创新和促进技术进步,对于提高全要素生产率和实现经济高质量发展尤为重要。然而,目前关于专利行政执法与全要素生产率的关系直接研究成果几乎没有,相关研究多集中在知识产权保护对全要素生产率的影响研究,研究的内容也较为宽泛,不能满足经济发展新常态下专利行政执法实践的指导需求。因此,本文基于相关理论基础和现有研究成果,深入探讨专利行政执法与全要素生产率的关系,从而为我国有效运用专利行政执法优势来提高全要素生产率提供参考。在文章结构安排上,本文首先在现有文献的基础上测算专利行政执法强度,运用Malmquist-DEA方法测全要素生产率指数,并从现实角度分析了专利行政执法与全要素生产率的发展现状,以图表形式初步验证专利行政执法与全要素生产率之间的关系。其次,本文以马克思产权理论以及中国特色知识产权保护等相关理论为基础,结合前沿文献研究范式,分析专利行政执法对全要素生产率的作用机制和影响路径,并相应提出理论假设。最后,本文选取2004-2017年我国30个省市区面板数据,利用中介效应和调节效应模型实证检验专利行政执法对全要素生产率的影响路径,并在此基础上进一步研究城镇化水平、市场化程度等控制变量对全要素生产率的影响。本文研究结果表明:（1）专利行政执法可以通过影响外商直接投资和研发投入间接影响全要素生产率,而且研发投入在专利行政执法与全要素生产率关系中的传导作用更加明显;（2）产业结构在我国专利行政执法与全要素生产率的关系中具有正向调节作用,产业结构升级会强化专利行政执法对全要素生产率的促进作用;（3）在我国特色的专利行政执法环境下,城镇化水平、市场化程度、人力资本水平以及地区经济发展水平对全要素生产率具有空间效应。因此,政府应加强专利行政执法,坚持对内外资企业的“同保护”,大力推进产业结构升级,不断丰富和完善专利行政执法内容。同时,在加强专利行政执法保过程中,需要充分考虑城镇化水平、市场化程度、人力资本水平和地区经济发展水平对全要素生产率的影响,全面促进我国全要素生产率的提高。