目的:　　基于宏基因组学和Miseq测序平台，研究补中益气法对饮食物过敏患者肛瘘术后创面局部菌群的影响，探索补中益气法促进创面愈合的调控机理。　　方法:　　1.挑选18例符合纳入标准的肛瘘术后患者的样品分为3组。　　2.饮食物过敏阳性的12例患者随机分为治疗组（补中益气组）与阳性对照组，饮食物过敏阴性6例作为阴性对照组。　　3.治疗组（补中益气组）运用具有补中益气疗效的芪参固脱合剂和基础治疗。阳性对照组和阴性对照组使用基础治疗。　　4.运用宏基因组学illumina Miseq测序平台，检测对比治疗组（补中益气组）、阳性对照组与阴性对照组的局部菌群变化。　　结果:　　1.治疗组、阳性对照组、阴性对照组三组患者创面愈合时间分别为(37.50±2.34)天、(42.6±5.27)天、(32.16±4.26)天，三组之间比较统计学有显著差异(P＜0.05)。　　2.门水平上，治疗组与阳性对照组比较，Bacteroidetes、Cyanobacteria、Fusobacteria、Proteobacteria4个门具有统计学差异(P＜0.05);治疗组与阴性对照组共检测14个门，仅Fusobacteria（梭菌门）具有统计学意义(P＜0.05)，其余13个菌门无统计学差异(P＞0.05);阳性对照组与阴性对照组在门水平上除Cyanobacteria（蓝藻门）外，无统计学差异。属水平上，阳性对照组与阴性对照组比较，发现Corynebacterium、Dermatophilus、Candidatus Rhodoluna、Saccharopolyspora、Emticicia、Bacillus、Clostridium、Bradyrhizobium、Rubellimicrobium、Alcaligenes、Comamonas、Morganella、Serratia、Stenotrophomonas等14个属在阳性对照组高于阴性对照组，Eggerthella、Dialister2个属在阳性对照组中低于阴性对照组;治疗组与阳性对照组比较，Eggerthella、Dorea、Dialister、Janthinobacterium、Bilophila等5个属在阳性对照组高于治疗组，Rhodococcus、Serratia2个属在阳性对照组低于治疗组。　　结论:　　1.饮食物过敏肛瘘患者术后创面愈合时慢于正常患者，补中益气法能够促进饮食物过敏肛瘘患者术后创面愈合。　　2.饮食物过敏肛瘘患者术后创面局部菌群与正常患者的菌群多样性和种群结构存在差异，特别是在属水平上(P＜0.05)。补中益气法能够改变饮食物过敏肛瘘术后创面局部菌群物种、丰度分布，在门水平上将其调节至与正常患者相似。　　3.补中益气法能够调节患者的免疫功能，特别是肠道免疫（血清IgA、肠道SIgA等），其干预创面愈合的机制可能是:补中益气法通过调节饮食物过敏肛瘘术后患者的免疫功能（尤其是肠道免疫），改变肠道菌群结构，影响与肠道相连通的肛瘘术后创面局部菌群的微生物多样性和种群结构，改变其代谢产物，最终促进创面愈合。具体作用途径需进行功能基因组学分析。