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刚地弓形虫(Toxoplasma gondii)是一种专性寄生于几乎所有有核细胞内的寄生性原虫。所致弓形虫病已成为中国一种重要的食源性、人兽共患性寄生虫病。目前,弓形虫病治疗面临着副作用强、根治率低、耐药株出现等问题。寻找高效、低毒抗弓形虫药物一直是防治研究中的重点。
Sir2全称沉默信号调节因子2(Silent information regulator2),是一类高度保守的、烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD+)依赖的组蛋白去乙酰化酶(histone deacetylase,HDAC),属第三类HDAC家族—sirtuins家族。
Sir2蛋白最早发现于酵母细胞中,随后在多种原核、真核细胞中被证实。人体内,Sir2被命名为SIRT2。SIRT2既可定位胞浆,也可入核,对胞浆蛋白、组蛋白或转录因子进行去乙酰化修饰。然而,对于弓形虫体内是否存在Sir2蛋白以及其功能目前尚未见相关报道。因此,为了证实弓形虫体内存在Sir2蛋白、阐明其酶活性,进行了以下研究,从而为抗弓形虫药物研发提供理论基础。
目的:
1.找到弓形虫基因组中潜在的sir2基因。
2.检测TgSir2a与TgSir2b的去乙酰化酶活性。
3.探究TgSir2a与TgSir2b蛋白在虫体中的定位。
方法:
1.BLAST比对寻找弓形虫基因组中潜在的sir2基因
以酵母Sir2氨基酸序列为模板,通过Blast搜索ToxoDB数据库,利用SignalP预测信号肽,利用TMHMM-2.0预测跨膜区域,利用Clustal Omega进行序列比对。
2.检测TgSir2a和TgSir2b的去乙酰化酶活性
2.1体外表达TgSir2a蛋白
2.1.1原核表达TgSir2a蛋白
(1)重组质粒pET-28b-TgSir2a△1-15aa的构建与鉴定
提取虫体总RNA、逆转录成cDNA后,以cDNA为模板,PCR扩增TgSir2a去掉前15个氨基酸信号肽(TgSir2a△1-15aa)的编码序列,酶切、连接后构建原核表达质粒:pET-28b-TgSir2a△1-15aa。质粒经测序验证正确后进行后续实验。
(2)TgSir2a蛋白诱导表达、纯化与鉴定
将测序正确的pET-28b-TgSir2a△1-15aa重组质粒经转化、诱导、超声,获得诱导后的上清和沉淀,做考马斯亮蓝法染色和Western Blot进行鉴定,将沉淀用盐酸胍过夜处理,经离心、过滤,镍柱纯化,做考染鉴定。
2.1.2真核表达TgSir2a蛋白
(1)重组质粒pFastBac1-TgSir2a△1-15aa的构建与鉴定
提取虫体总RNA、逆转录成cDNA后,以cDNA为模板,PCR扩增TgSir2a△1-15aa,酶切、连接后构建真核表达质粒:pFastBac1-TgSir2a△1-15aa。将测序正确的质粒转化DH10Bac感受态,得到重组杆状病毒Bacmid质粒,经过蓝白斑筛选,将白色菌落送公司测序验证,测序正确后进行后续实验。
(2)TgSir2a重组蛋白的大量表达与鉴定
将测序正确的TgSir2重组杆状病毒Bacmid质粒转染入Sf9细胞并于28℃培养箱中培养,将获得的蛋白进行考马斯亮蓝染色和Western Blot实验验证。
2.2原核表达TgSir2b蛋白
(1)重组质粒pGEX-6p-1-TgSir2b的构建与鉴定
提取虫体总RNA、逆转录成cDNA后,以cDNA为模板,PCR扩增TgSir2b编码序列,酶切、连接后构建原核表达质粒:pGEX-6p-1-TgSir2b。质粒经测序验证正确后进行后续实验。
(2)TgSir2b蛋白诱导表达、纯化与鉴定
将测序正确的GST-TgSir2b重组质粒经转化、诱导、超声,获得诱导后的上清和沉淀,做考马斯亮蓝法染色和Western Blot进行鉴定,将沉淀用盐酸胍过夜处理,经离心、过滤,Glutathione-SepharoseTM4B介质纯化,做考染鉴定。
2.3弓形虫去乙酰化酶TgSir2a和TgSir2b酶活性的检测
通过使用Epigenas?Universal SIRT Activity/Inhibition Assay Kit(Colormetric)试剂盒检测原核、真核表达的TgSir2a与原核表达的TgSir2b的去乙酰化酶活性。
3.探究TgSir2a和TgSir2b蛋白在速殖子增殖周期中的定位
3.1TgSir2a抗体的制备及验证
将纯化后的HIS-TgSir2a△1-15aa融合蛋白背部皮下多点注射免疫2只新西兰大白兔,共免疫3次,免疫结束后,采集兔血清,用弓形虫全虫蛋白和纯化的His-TgSir2a△1-15aa蛋白作为样品,用获得的血清作为一抗进行验证。用间接酶联免疫吸附试验(ELISA)法检测免疫后兔血清抗体效价。
3.2TgSir2b抗体的制备及验证
将制备好的TgSir2b的多肽背部皮下多点注射免疫5只BALB/c小鼠,共免疫3次,免疫结束后,采集鼠血清,用弓形虫全虫蛋白和纯化的GST-TgSir2b蛋白作为样品,用获得的血清作为一抗进行验证。用间接ELISA法检测免疫后鼠血清抗体效价。
3.3TgSir2a和TgSir2b在速殖子增殖周期中定位的探究
利用制备的抗兔anti-TgSir2a和抗鼠anti-TgSir2b抗体作为一抗,做12h时细胞内虫体和细胞外虫体IFA实验,探究其在虫体生长发育过程中的定位。
结果:
1.BLAST比对寻找弓形虫基因组中潜在的sir2基因
查找到TgSir2序列(TGGT1_227020),碱基数为1083bp、蛋白大小为40kD,经预测有信号肽、无跨膜区域。在本研究中将其命名为TgSir2a。
查找到TgSir2-like序列(TGGT1_410770),碱基数为2832bp、蛋白大小为100kD,经预测无信号肽、无跨膜区域。在本研究中将其命名为TgSir2b。
2.检测TgSir2a和TgSir2b的去乙酰化酶活性
2.1体外表达TgSir2a蛋白
2.1.1原核表达TgSir2a蛋白
常规分子生物学方法构建pET-28b-TgSir2a△1-15aa原核表达质粒后经双酶切、测序验证成功;利用IPTG诱导后,考马斯亮蓝R-250染色实验和Western Blot实验证实重组蛋白HIS-TgSir2a△1-15aa表达成功,且蛋白表达在沉淀中;经镍柱纯化,用考马斯亮蓝法证实可得到单一的条带,说明蛋白纯化成功。
2.1.2真核表达TgSir2a蛋白
常规分子生物学方法构建pFastBac1-TgSir2a△1-15aa真核表达质粒后经双酶切、测序验证成功;收集病毒经考马斯亮蓝染色和Western Blot证实TgSir2a蛋白真核表达成功。
2.2原核表达TgSir2b蛋白
常规分子生物学方法构建pGEX-6p-1-TgSir2b原核表达质粒后经双酶切、测序验证成功;利用IPTG诱导后,考马斯亮蓝染色实验和Western Blot实验证实重组蛋白GST-TgSir2b表达成功,且蛋白表达在沉淀中;经纯化,用考马斯亮蓝法证实可得到单一的条带,说明蛋白纯化成功。
2.3TgSir2a和TgSir2b去乙酰化酶活性的检测
TgSir2a的原核表达蛋白和真核表达蛋白均具有组蛋白去乙酰化酶活性,且具有浓度依赖性,同时两者的酶活性差不多大;此外,TgSir2b原核表达蛋白同样具有组蛋白去乙酰化酶活性,且有浓度依赖性。经比较,TgSir2b酶活性显著高于TgSir2a。
3.探究TgSir2a和TgSir2b蛋白在虫体生长发育过程中的定位
3.1兔抗TgSir2a多克隆抗体的制备
Western blot和ELISA证实兔抗TgSir2a、鼠抗TgSir2b多克隆抗体制备成功且两个抗体效价均达到了1:64000。
3.2TgSir2a和TgSir2b在虫体中的定位
IFA实验证实,当虫体处于细胞外环境时,两个蛋白均定位于虫体胞浆中,而当虫体处于胞内生活环境时,两个蛋白均有向虫体膜上聚集的趋势。
结论:
本研究共发现弓形虫基因组中两个潜在的TgSir2蛋白:TgSir2a与TgSir2b。为了检测TgSir2a和TgSir2b的去乙酰化酶活性,利用原核表达和杆状病毒表达系统真核表达蛋白,分别检测酶活性,得出:两个蛋白均具备组蛋白去乙酰化酶活性,其中TgSir2b的酶活性显著高于TgSir2a。为了探究两种蛋白在弓形虫速殖子生长发育过程中的定位,制备了兔抗TgSir2a多克隆抗体和鼠抗TgSir2b多克隆抗体,用此抗体对目的蛋白的定位进行了研究,可以得出:当弓形虫速殖子从胞外到胞内的生存过程中,两个蛋白均有向虫体膜上聚集的趋势。本研究为进一步阐明TgSir2在弓形虫体内的功能、并以此为靶点研发抗弓形虫药物提供了有利的理论依据和实验材料。
Sir2全称沉默信号调节因子2(Silent information regulator2),是一类高度保守的、烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD+)依赖的组蛋白去乙酰化酶(histone deacetylase,HDAC),属第三类HDAC家族—sirtuins家族。
Sir2蛋白最早发现于酵母细胞中,随后在多种原核、真核细胞中被证实。人体内,Sir2被命名为SIRT2。SIRT2既可定位胞浆,也可入核,对胞浆蛋白、组蛋白或转录因子进行去乙酰化修饰。然而,对于弓形虫体内是否存在Sir2蛋白以及其功能目前尚未见相关报道。因此,为了证实弓形虫体内存在Sir2蛋白、阐明其酶活性,进行了以下研究,从而为抗弓形虫药物研发提供理论基础。
目的:
1.找到弓形虫基因组中潜在的sir2基因。
2.检测TgSir2a与TgSir2b的去乙酰化酶活性。
3.探究TgSir2a与TgSir2b蛋白在虫体中的定位。
方法:
1.BLAST比对寻找弓形虫基因组中潜在的sir2基因
以酵母Sir2氨基酸序列为模板,通过Blast搜索ToxoDB数据库,利用SignalP预测信号肽,利用TMHMM-2.0预测跨膜区域,利用Clustal Omega进行序列比对。
2.检测TgSir2a和TgSir2b的去乙酰化酶活性
2.1体外表达TgSir2a蛋白
2.1.1原核表达TgSir2a蛋白
(1)重组质粒pET-28b-TgSir2a△1-15aa的构建与鉴定
提取虫体总RNA、逆转录成cDNA后,以cDNA为模板,PCR扩增TgSir2a去掉前15个氨基酸信号肽(TgSir2a△1-15aa)的编码序列,酶切、连接后构建原核表达质粒:pET-28b-TgSir2a△1-15aa。质粒经测序验证正确后进行后续实验。
(2)TgSir2a蛋白诱导表达、纯化与鉴定
将测序正确的pET-28b-TgSir2a△1-15aa重组质粒经转化、诱导、超声,获得诱导后的上清和沉淀,做考马斯亮蓝法染色和Western Blot进行鉴定,将沉淀用盐酸胍过夜处理,经离心、过滤,镍柱纯化,做考染鉴定。
2.1.2真核表达TgSir2a蛋白
(1)重组质粒pFastBac1-TgSir2a△1-15aa的构建与鉴定
提取虫体总RNA、逆转录成cDNA后,以cDNA为模板,PCR扩增TgSir2a△1-15aa,酶切、连接后构建真核表达质粒:pFastBac1-TgSir2a△1-15aa。将测序正确的质粒转化DH10Bac感受态,得到重组杆状病毒Bacmid质粒,经过蓝白斑筛选,将白色菌落送公司测序验证,测序正确后进行后续实验。
(2)TgSir2a重组蛋白的大量表达与鉴定
将测序正确的TgSir2重组杆状病毒Bacmid质粒转染入Sf9细胞并于28℃培养箱中培养,将获得的蛋白进行考马斯亮蓝染色和Western Blot实验验证。
2.2原核表达TgSir2b蛋白
(1)重组质粒pGEX-6p-1-TgSir2b的构建与鉴定
提取虫体总RNA、逆转录成cDNA后,以cDNA为模板,PCR扩增TgSir2b编码序列,酶切、连接后构建原核表达质粒:pGEX-6p-1-TgSir2b。质粒经测序验证正确后进行后续实验。
(2)TgSir2b蛋白诱导表达、纯化与鉴定
将测序正确的GST-TgSir2b重组质粒经转化、诱导、超声,获得诱导后的上清和沉淀,做考马斯亮蓝法染色和Western Blot进行鉴定,将沉淀用盐酸胍过夜处理,经离心、过滤,Glutathione-SepharoseTM4B介质纯化,做考染鉴定。
2.3弓形虫去乙酰化酶TgSir2a和TgSir2b酶活性的检测
通过使用Epigenas?Universal SIRT Activity/Inhibition Assay Kit(Colormetric)试剂盒检测原核、真核表达的TgSir2a与原核表达的TgSir2b的去乙酰化酶活性。
3.探究TgSir2a和TgSir2b蛋白在速殖子增殖周期中的定位
3.1TgSir2a抗体的制备及验证
将纯化后的HIS-TgSir2a△1-15aa融合蛋白背部皮下多点注射免疫2只新西兰大白兔,共免疫3次,免疫结束后,采集兔血清,用弓形虫全虫蛋白和纯化的His-TgSir2a△1-15aa蛋白作为样品,用获得的血清作为一抗进行验证。用间接酶联免疫吸附试验(ELISA)法检测免疫后兔血清抗体效价。
3.2TgSir2b抗体的制备及验证
将制备好的TgSir2b的多肽背部皮下多点注射免疫5只BALB/c小鼠,共免疫3次,免疫结束后,采集鼠血清,用弓形虫全虫蛋白和纯化的GST-TgSir2b蛋白作为样品,用获得的血清作为一抗进行验证。用间接ELISA法检测免疫后鼠血清抗体效价。
3.3TgSir2a和TgSir2b在速殖子增殖周期中定位的探究
利用制备的抗兔anti-TgSir2a和抗鼠anti-TgSir2b抗体作为一抗,做12h时细胞内虫体和细胞外虫体IFA实验,探究其在虫体生长发育过程中的定位。
结果:
1.BLAST比对寻找弓形虫基因组中潜在的sir2基因
查找到TgSir2序列(TGGT1_227020),碱基数为1083bp、蛋白大小为40kD,经预测有信号肽、无跨膜区域。在本研究中将其命名为TgSir2a。
查找到TgSir2-like序列(TGGT1_410770),碱基数为2832bp、蛋白大小为100kD,经预测无信号肽、无跨膜区域。在本研究中将其命名为TgSir2b。
2.检测TgSir2a和TgSir2b的去乙酰化酶活性
2.1体外表达TgSir2a蛋白
2.1.1原核表达TgSir2a蛋白
常规分子生物学方法构建pET-28b-TgSir2a△1-15aa原核表达质粒后经双酶切、测序验证成功;利用IPTG诱导后,考马斯亮蓝R-250染色实验和Western Blot实验证实重组蛋白HIS-TgSir2a△1-15aa表达成功,且蛋白表达在沉淀中;经镍柱纯化,用考马斯亮蓝法证实可得到单一的条带,说明蛋白纯化成功。
2.1.2真核表达TgSir2a蛋白
常规分子生物学方法构建pFastBac1-TgSir2a△1-15aa真核表达质粒后经双酶切、测序验证成功;收集病毒经考马斯亮蓝染色和Western Blot证实TgSir2a蛋白真核表达成功。
2.2原核表达TgSir2b蛋白
常规分子生物学方法构建pGEX-6p-1-TgSir2b原核表达质粒后经双酶切、测序验证成功;利用IPTG诱导后,考马斯亮蓝染色实验和Western Blot实验证实重组蛋白GST-TgSir2b表达成功,且蛋白表达在沉淀中;经纯化,用考马斯亮蓝法证实可得到单一的条带,说明蛋白纯化成功。
2.3TgSir2a和TgSir2b去乙酰化酶活性的检测
TgSir2a的原核表达蛋白和真核表达蛋白均具有组蛋白去乙酰化酶活性,且具有浓度依赖性,同时两者的酶活性差不多大;此外,TgSir2b原核表达蛋白同样具有组蛋白去乙酰化酶活性,且有浓度依赖性。经比较,TgSir2b酶活性显著高于TgSir2a。
3.探究TgSir2a和TgSir2b蛋白在虫体生长发育过程中的定位
3.1兔抗TgSir2a多克隆抗体的制备
Western blot和ELISA证实兔抗TgSir2a、鼠抗TgSir2b多克隆抗体制备成功且两个抗体效价均达到了1:64000。
3.2TgSir2a和TgSir2b在虫体中的定位
IFA实验证实,当虫体处于细胞外环境时,两个蛋白均定位于虫体胞浆中,而当虫体处于胞内生活环境时,两个蛋白均有向虫体膜上聚集的趋势。
结论:
本研究共发现弓形虫基因组中两个潜在的TgSir2蛋白:TgSir2a与TgSir2b。为了检测TgSir2a和TgSir2b的去乙酰化酶活性,利用原核表达和杆状病毒表达系统真核表达蛋白,分别检测酶活性,得出:两个蛋白均具备组蛋白去乙酰化酶活性,其中TgSir2b的酶活性显著高于TgSir2a。为了探究两种蛋白在弓形虫速殖子生长发育过程中的定位,制备了兔抗TgSir2a多克隆抗体和鼠抗TgSir2b多克隆抗体,用此抗体对目的蛋白的定位进行了研究,可以得出:当弓形虫速殖子从胞外到胞内的生存过程中,两个蛋白均有向虫体膜上聚集的趋势。本研究为进一步阐明TgSir2在弓形虫体内的功能、并以此为靶点研发抗弓形虫药物提供了有利的理论依据和实验材料。