MYB转录因子超家族是植物发育和响应环境变化的关键调控因子。植物生活方式和形态特征的多样性可能与MYB超家族基因数量的动态变化有关。然而,目前对绿色植物MYB超家族的系统发育分析尚不全面。为了深入了解MYB基因家族对植物特别是开花植物进化历程的作用,我们对22个大类437个植物物种进行了MYB基因家族的全基因组鉴定及后续的分析。主要研究结果如下:1、鉴定了437个物种中MYB家族成员,发现开花植物中MYB基因的平均数量是非开花植物的6倍。在开花植物中,2R-MYB亚家族成员的占比更高,而非开花植物中1R-MYB亚家族成员占比更高。相比于开花植物,非开花植物的MYB基因数量具有更大的变异系数。2、鉴定了物种内部的MYB基因对,发现开花植物拥有较多MYB基因对。随后计算了这些基因对的Ka和Ks值,Ks值的分布表明大多数开花植物都经历了近期的MYB基因加倍,且开花植物中的Ka/Ks＞1的基因对更多,表明开花植物普遍面临更大的环境选择压力。另外,通过与真菌的比较基因组学分析,我们鉴定到一个植物与真菌间可能发生水平基因转移事件的MYB基因。3、从22个类别中共挑选了53种植物进行新/亚功能化分析。表达数据显示,相比于其他组织,植物的根、茎、叶和花中表达的基因（RPKM＞5）更多。随后,我们分析开花植物中MYB基因对的共表达模式,发现非对称表达的基因对数量最多。4、在开花植物中,多个MYB分支表现出高度保守的拷贝数和共线性模式,而其他分支则表现出更具多变性,具有明显的物种特异性的模式。作为MYB分支动态变化导致物种特异性形态分化的例子,我们猜测分支OG0000000和OG0000008的获得与开花植物的出现有关。此外,MYB基因对的新/亚功能化促进了物种对环境的适应,物种特异性的新/亚功能化促进了不同物种的表型分化。本研究首次从泛植物尺度揭示了MYB超家族在开花物种和非开花物种上的进化差异,初步探讨了MYB基因家族物种特异性和保守性的进化机制,表明了MYB家族在植物对环境适应性和物种表型分化中的关键角色。该研究为植物的演化提供了一定的参考,也为后续构建数据库提供了数据基础。