当前我国的经济正处于转型升级的关键时期,科技创新作为经济增长的内生动力,在推动经济发展的过程中发挥着越来越大的作用。基于此,2005年中央政府提出了在2020年将我国建设成为创新型国家的宏伟目标,2008年深圳启动建设国家创新型城市正式拉开了我国创新型城市建设工作的帷幕。由于建设创新型国家和创新型城市是一项长期又艰巨的任务,我国尚处于经验探索阶段,因此对创新型城市科技创新效率进行研究对加快推进我国创新型城市建设具有一定的意义。首先,本文在对国内外相关文献进行了一定的研究基础之上,对创新型城市的概念、构成要素、创新型城市类型和发展阶段进行了梳理和评价,给出了本文认为的创新型城市的基本概念;并对创新的相关理论和研究进行了梳理。其次对我国整体以及长三角创新型城市的科技创新资源投入和科技创新产出状况进行了描述分析,并对区域间的差异进行了比较研究。在此之后本文通过构建三阶段超效率DEA模型对长三角20个创新型城市的科技创新投入产出效率进行了测算,并根据测算结果对长三角各创新型城市的效率差异和科技创新投入冗余与产出不足进行了分析,发现长三角核心城市存在科技创新资源与科技创新能力不匹配等问题。最后根据实证结果,提出了长三角要完善人才一体化培养机制、加强协同创新的平台载体建设、建设开放型创新网络、发挥科技创新空间示范效应以及通过调整产业布局提高科技创新的规模效率的对策建议。