论文部分内容阅读
有机污染物类比技术对于有机化合物的生态风险性评价与管理具有重要意义，在欧美等发达国家已得到应用。类比技术能够简单而快速地判别污染物的毒性级别，对其进行大体上的分类，为环境风险因子识别提供基础数据。
MOLPRINT2D是一个基于相似性原理的计算分子相似性的软件，在计算机辅助药物设计、食品和化妆品研究等相关领域都有应用。该软件通过表征分子结构，采用Tanimoto方法计算相似性，具有计算快速，结果准确的优点。
本研究选取了1093种有机污染物，以其中644种化合物为训练集，另外339种化合物和110种化合物作为两个验证集，以这些化合物对淡水四膜虫(Tetrahymenapyriformis(strainGL-C))半数生长活性抑制浓度(pIGC50)为毒性指标，应用OpenBabel和MOLPRINT2D软件，选取合适的计算参数，对验证集化合物进行相似性计算，并应用此类比方法，对验证集化合物毒性进行了预测。具体工作包括：
(1)利用OpenBabel和MOLPRINT2D软件中的Mol22aefp程序，将数据集化合物分子结构表示法由Smiles格式转变为Sybylmol2格式。然后应用MOLPRINT2D软件中的其他程序进行后续计算。
(2)通过对数据的分析，选取最优的分子结构层次和分子结构描述参数，以简化对验证集2的计算和分析的工作。
(3)根据对验证集1的结论，提出利用MOLPRINT2D方法计算后的化合物分类方案，对验证集2的化合物的半数生长活性抑制浓度值(pIGC50)进行预测，并提出利用加标化合物计算基点的方法。