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团头鲂(Megalobrama amblycephala)又名武昌鱼,是一种草食性鲤科鱼类。它的天然栖息地局限于长江中下游的一些大中型湖泊。自从1955年定种以来,团头鲂逐渐成为人们喜爱的桌上佳肴,到2001年时,团头鲂的总产量达到541115吨,这意味它已经成为我国最重要的淡水经济鱼种之一。
为了评估野生团头鲂的遗传结构,本研究使用FIASCO(Fast isolation by AFLPsequences containing repeats)法开发了24个团头鲂多态性微卫星标记,从中选出10个分析梁子湖、鄱阳湖和淤泥湖的野生团头鲂的遗传结构。结果显示,梁子湖团头鲂群体与淤泥湖野生团头鲂群体之间的遗传差异最大。基于这个结果,我们从淤泥湖野生群体中选择了一尾雄性与一尾来自于梁子湖的雌性交配,以产生作图群体,最后利用作图群体分别构建了雌雄团头鲂的遗传连锁图谱。具体研究结果如下:
1.微卫星标记的开发
本研究使用FIASCO法成功地构建了团头鲂微卫星富集文库。从团头鲂中一共分离了192个含有基因组片段的克隆并送去测序,含有微卫星片段的克隆有170个,占全部克隆总数的88.5％。基于这些测序结果,设计并合成了60对微卫星引物,扫描混合群体进行验证,总计24对引物显示出多态性。这些引物扩增位点的等位基因数在3到11之间,观测杂合度为0.415到0.843,期望杂合度的范围在0.368到0.866之间。这些结果都证实全部这些引物有良好的多态性,可以用于后续的实验。
2.三个团头鲂野生群体的遗传结构分析
从上述24对引物中挑选10对引物对梁子湖、淤泥湖和鄱阳湖三个团头鲂野生群体的遗传结构进行分析。这10对引物一共产生了136个等位基因,每个位点的等位基因数在4到8个之间变化。所有三个群体的观测杂合度在0.6061到0.9231之间变化,而期望杂合度则在0.6690到0.8838之间。一共有8个位点被观测到显著偏离Hardy-Weinberg平衡(P<0.01)。基于固定指数Fst的遗传分化研究指出在梁子湖群体和淤泥湖群体之间存在中等程度的遗传分化(0.05
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