论文部分内容阅读
目的:1、回顾分析衢州地区皮肤软组织感染社区获得性金黄色葡萄球菌,检测其耐药及毒力基因携带情况,为临床用药提供指导。2、分析衢州地区皮肤软组织感染社区获得性甲氧西林耐药金黄色葡萄球菌(Community-acquired methicillin-resistant Staphylococcus aureus,CA-MRSA)的分子特征及毒力基因携带情况。3、对新序列型ST5423进行全基因测序分析,并与SR434 ST88进行比较,重点分析了毒力和耐药基因。方法:1、回顾分析2014年至2018年本院皮肤软组织感染样本中分离到的金黄色葡萄球菌,从中筛选出社区获得性感染菌株,检测药敏及毒力基因携带情况。2、对CA-MRSA菌株采用多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)方法进行分子分型。3、对新发现的序列型ST5423使用Illumina Hi Seq X-ten平台进行二代测序,测序完成后使用Shovill进行拼接,使用RAST(网址https://rast.nmpdr.org/)进行基因注释,在CGE(网址http://www.genomicepidemiology.org/)上进行毒力基因及耐药基因筛选。结果:1、共筛选到社区获得性致SSTIs金黄色葡萄球菌246株,其中CA-MRSA菌株(29.27%,72/246)。致SSTIs CA-MRSA的分离率呈逐年上升趋势,从2014年的23.08%到2018年的39.02%。社区获得致SSTIs金黄色葡萄球菌对青霉素的耐药率高达(226/246,91.87%),对红霉素耐药率为(148/246,60.16%)。致SSTIs CA-MRSA对红霉素(90.28%,65/720、克林霉素(68.06%,49/72)、四环素(41.67%,30/72)具有较高的耐药率,对喹诺酮类、复方磺胺甲噁唑耐药率低。未检测到万古霉素、呋喃妥因、利奈唑胺、达托霉素耐药株。CA-MRSA对红霉素、克林霉素、四环素及青霉素的耐药率显著高于甲氧西林敏感金黄色葡萄球菌(methicillin susceptible Staphylococcus aureus,MSSA)(P<0.05)。这些分离株的毒力基因携带率分别为hla(233/246,94.72%)、hlb(58/246,23.58%)、PVL(99/246,40.24%)、fnb A(135/246,54.88%)、fnb B(112/246,45.53%)、sec(15/246,6.10%)、seh(9/246,3.66%)。CA-MRSA与MSSA相比PVL、hlb基因的携带率更高(P<0.05)。2、致SSTIs CA-MRSA中ST59为主要流行株,占(55.56%,40/72)。ST59CA-MRSA对克林霉素(85.00%,34/40)、红霉素(87.50%,35/40)、四环素(42.50%,17/40)有较高的耐药率。ST59对克林霉素的耐药率明显高于其他克隆型(P<0.05)。ST59 CA-MRSA菌株PVL携带率为(77.50%,31/40)。PVL基因在ST59型中的表达率显著高于在其他非ST59型中的表达(P<0.05)。3、四株ST5423与SR434相比均携带有胞外酶基因aur,spl A,spl B,宿主基因sak,scn,毒素基因hlg A,hlg B,hlg C,Luk D,Luk E,耐药基因lnu A,bla Z,mec A,erm C。但四株ST5423均PVL基因阳性,SR434 PVL基因阴性。SR434中检出较多的肠毒素基因sec,sel,sea/sep,ST5423仅有sep一种肠毒素基因。ST5423中检测到介导复方磺胺甲噁唑耐药的基因dfr G,SR434中不携带。但SR434中携带磷霉素耐药基因fos B。四株菌对头孢西丁、青霉素、红霉素耐药。QZ04和QZ06对复方磺胺甲噁唑耐药。结论:1、衢州地区SSTIs社区获得性金黄色葡萄球菌对青霉素、红霉素的耐药率较高,在临床经验性用药中不应作为首选用药,喹诺酮类、复方磺胺甲恶唑、万古霉素等可用于经验性用药。2、衢州地区致SSTIs CA-MRSA的检出率较高,且有逐年上升趋势,CA-MRSA对红霉素、克林霉素、四环素及青霉素具有较高的耐药率,不推荐使用,对复方磺胺甲噁唑及大多数氟喹诺酮类药物耐药率低于10%,对万古霉素、达托霉素、利奈唑胺全部敏感,临床治疗中可试用。3、衢州致SSTIs CA-MRSA的主要流行株为ST59型,与国内其他地区一致,ST59型分离株PVL基因的携带率明显高于其他分离株。4、四株ST5423具有高度的一致性,似乎具有更强的毒力和更广谱的耐药性,是否会引起广泛流行需要进一步监测。