基因组序列的复杂性分析及生物信息的提取

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该文对已知的28个基因组序列进行了统计分析并对基因组中的复杂性进行了研究.我们第一个要解决的问题是如何描述和解释这些基因组序列.我们使用了一种数学语言,也就是“碱基分布曲线”法来描述这些原始的基因组数据.碱基分布曲线可以包括完整基因组序列的全部信息,并且形式较为直观,因此基因组碱基分布曲线的形状可以作为对基因组序列最初步的一个完整的、简单的数学描述.这种描述方法可以直接反映诸如原核基因组复制起点和复制终点、生物的三界差别等性质,并且与目前已有的生物分类相一致.然后我们试图从一个全新的视角观察基因组中局部序列碱基密度与大范围序列碱基密度之间的关系,揭示基因组的内在组成方式及其复杂性.在此基础上,该文发展了多变量EDP方法描述和识别生物特性或功能的序列片段如:外显子和内含子.结果表明,我们可以用此方法可以成功的预测外显子.为了进一步提高外显子预测的准确度和灵敏度,我们对多种基因组的基因结构进行了进一步的统计分析.
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