北京地区犬瘟热、犬细小病毒感染及犬冠状病毒病的分子流行病学调查

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2007年12月~2008年5月对北京地区的犬病流行情况进行了调查,共调查犬404只,其中患犬瘟热41只,细小病毒性肠炎115只,犬冠状病毒病86只,主要以细小病毒性肠炎多发。本次调查疾病的样品阳性检出率与病犬的免疫预防有一定的关系,定期免疫的犬发病少,未免疫的犬样品阳性检出率高,说明未免疫的犬易感染犬瘟热等病,定期免疫可提高机体免疫力。本试验分析了犬病流行病学的特点,并提出了今后的防治措施和意见。根据发表的犬瘟热病毒(CDV)参考毒株Onderstepoort的序列设计了一对引物,以感染犬瘟热病毒的犬的粪便总RNA为模板,RT-PCR扩增出17株CDV的H全基因1877 bp的片段,将这个片段连接到pGEM-T easy载体上,经酶切鉴定得到阳性克隆,将阳性质粒进行序列测定,并与国内外毒株进行同源性比较和系统发育分析,结果显示17株均为Asia-1型。北京地区2008年流行的毒株主要是Asia-1型。本试验研究了CPV VP2297位点(Ser变为A1a)的变异情况。根据VP2位点297的改变引起限制性内切酶AluI酶切位点的变化,建立PCR依赖性限制性片段长度多态性分析(PCR-RFLP)方法,检测VP2297位点的变异。通过基因进化树的分析表明,国内外的CPV起源于共同的祖先。同时根据GenBank中CPV-d株(M23255)VP2的基因序列和CPV-2、CPV-2a与CPV-2b的氨基酸位点差异,建立区分CPV-2、CPV-2a与CPV-2b的等位基因特异PCR,应用型特异性PCR将CPV-2与CPV-2a及CPV-2b区分开来,应用检测点突变的等位基因特异PCR,将CPV-2a与CPV-2b区分开来。在随机抽取的40个CPV阳性样品中,CPV-2、CPV-2a、CPV-2b分别占抽取样品总数的5%、77.5%和17.5%。目前CPV-2a与CPV-2b共同存在于犬群中。本试验采用Pratelli等建立的套式PCR方法,对采集自北京地区的犬粪便样品进行CCV检测和基因型分析,以调查CCV的流行情况及病毒的基因型。自2007年12月至2008年5月的6个月内收集的86份犬冠状病毒(CCV)阳性粪便样品中,随机抽取28份采自不同地点不同时期的样品,用可鉴定基因型的套式PCR方法检测,结果显示,28份随机样品中有25份检出Ⅱ型CCV,3份样品检出Ⅰ型CCV。说明北京地区犬冠状病毒流行的基因型以CCVⅡ型为主。
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