人源RBM25蛋白的PWI结构域及其邻近碱性区域的结构与功能研究

来源 :中国科学技术大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:uuuuuuuuii
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
人源RBM25蛋白是一个新的剪切因子,它能调控细胞凋亡因子Bcl-x基因的选择性剪切。Bcl-x pre-mRNA上含有3个外显子,其中外显子1和3是组成型的外显子,而外显子2则是一个选择性剪切的外显子。RBM25蛋白表达量的增高伴随着Bcl-xS剪接体形式的上调。研究发现RBM25蛋白能够特异性的结合在Bcl-x pre-mRNA的外显子剪切增强子序列CGGGCA上,该序列位于外显子2上。体内和体外的实验均证明RBM25蛋白和U1 snRNP的辅助因子Luc7A具有直接的相互作用,但是RBM25蛋白和U1 snRNP的Sm蛋白以及U1A,U1C,U1-70K蛋白均没有直接的相互作用。因此,RBM25蛋白激活Bcl-xS5端剪切位点的机制为:RBM25蛋白特异性地结合在外显子剪切增强子序列CGGGCA上,并通过与U1 snRNP的辅助因子Luc7A蛋白的相互作用来辅助招募U1 snRNP剪接体到Bcl-xS5端剪切位点执行剪切。RBM25蛋白含有一个PWI结构域,PWI结构域是一类新型的结合RNA的结构域,对单链和双链的核酸均具有相同的亲和力。但是目前人们对PWI结构域的功能还知之甚少,仅知道SRm160蛋白的PWI结构域在SRm160蛋白所促进的3端形成中发挥着重要功能。另外,PWI结构域的邻近具有一段富含碱性氨基酸的区域,长度约为10个氨基酸,被称为邻近碱性区域,研究发现该邻近碱性区域是PWI结构域结合RNA时必不可少的一个合作伙伴,如果没有该邻近碱性区域的存在,PWI结构域将不能结合核酸。目前仅有两个PWI结构域的结构被解析,分别为:SRm160 PWI结构域(PDB号:1MP(1))和Prp3 PWI结构域(1X4Q)。它们的结构表明PWI结构域的结构主要是由一个高度保守的四股螺旋束组成,但是在这两个结构中,并没有包含其邻近碱性区域。   为了探索RBM25 PWI结构域在RBM25蛋白所调控的Bcl-x pre-mRNA的选择性剪切中是否发挥作用,其邻近碱性区域是否具有二级结构,其邻近碱性区域如何帮助PWI结构域结合核酸,以及PWI结构域结合核酸时的重要接触残基是哪些等问题,我们采用X射线晶体学的方法解析了PWI结构域及其邻近碱性区域的2.9(A)分辨率的晶体结构,首次报道了邻近碱性区域的晶体结构。它形成了两段小的α螺旋,并且和PWI结构域的核心H4螺旋相互作用,正是这些相互作用力的存在,促使PWI结构域的碱性氨基酸与邻近碱性区域上的碱性氨基酸富集在一起,形成了一个更大的带正电荷的表面,从而给核酸提供了一个更大的结合界面。另外,我们还分别找到了PWI结构域及其邻近碱性区域结合核酸时的重要接触残基,并发现RBM25 PWI结构域结合核酸时的界面和SRm160 PWI结合核酸的界面完全不同,从而表明PWI结构域结合核酸时采用的是多元化的结合界面。我们通过RT-PCR的实验证明了PWI结构域在RBM25蛋白所调控的Bcl-x pre-mRNA的选择性剪切中发挥着重要的作用。最后我们还发现RNA分子可以作为连接PWI结构域和Luc7AC(Luc7A蛋白的C端)的桥梁,但是这三者的复合物是否在Bcl-x pre-mRNA的选择性剪切中具有生物学功能还需要进一步的研究。   本论文分成三章进行阐述:第一章为研究背景的阐述;第二章为实验材料与方法;第三章为实验结果与讨论。
其他文献
会议
水通道蛋白(AQP)对水具有极高的渗透性,有可能在仿生废水回收以及海水淡化等领域具有潜在的重要应用价值。本论文的研究目标是对来源于深海嗜压菌Photobacterium profundum SS
单晶型的有机无机杂化材料通常包括无机阴离子簇、金属节点和有机分子配位组成的阳离子,可以将多重功能的基团引入到一个框架之中,在阴阳离子之间产生协同作用,常常赋予了这
重整抽提油中往往含有微量的烯烃杂质,这部分烯烃杂质性质比较活泼,极易形成有机沉积物而影响吸附剂的寿命,并且将影响单体芳烃产品的质量,为了延长吸附剂的寿命,保证生产流
由于人们节约能源和环保意识的增强,水性涂料的研究和开发引起了人们越来越多的关注,具有非常广阔的发展前景。丙烯酸酯共聚物(PA)乳液和水性聚氨酯(WPU)分散乳液都是目前市场