研究背景手足口病(Hand,foot and mouth disease,HFMD)是一种常见的在世界范围内流行的儿童急性传染病,可由多种肠道病毒(Enterovirus,EV)感染引起发病,发病率和死亡率在我国法定报告传染病中常年位于前几位。根据以往的研究显示,引起我国HFMD的最常见病原体为肠道病毒A组71型(Enterovirus A71,EV-71)和柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus,CV-A16),两种病原体呈交替流行趋势。但是近年来关于由柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus,CV-A6)引起的HFMD的报道不断增多,甚至在很多地区已经超多EV-A71和CV-16成为主要致病病原体之一。HFMD对我国公共卫生方面的影响不容忽视。研究目的1.对宁夏回族自治区2017~2018年HFMD的发病情况开展监测工作,了解本地区HFMD的流行特征及病原谱构成情况。2.对本地区分离出的CV-A6毒株进行分子流行病学分析,通过对VP1区序列及基因组全长序列的分析,了解CV-A6宁夏株的基因特征。研究方法1.通过对宁夏回族自治区2017~2018年HFMD监测数据的分析,描述其在本地区的流行特征。2.通过实验室对病毒的检测和分离结果分析,对病原谱构成进行描述。3.通过对分离出的CV-A6毒株进行测序和遗传进化分析,了解CV-A6的基因特征。研究结果1.2017~2018年宁夏回族自治区共报告HFMD病例14698例,2017年发病率为111.62/10万,2018年发病率为105.09/10万。2.宁夏回族自治区HFMD发病有明显的季节性特点,主要集中在夏秋季节,发病高峰期为一主一次双峰分布,第一个发病高峰期为5~8月份,第二个发病高峰期为10~11月份。3.宁夏回族自治区HFMD在五个市均有发病,但发病人数差异较大,2017年和2018年发病人数从高到低均为:银川市、吴忠市、中卫市、石嘴山市、固原市。银川市发病人数最多,两年分别占发病总人数的47.03%和60.08%。4.宁夏回族自治区HFMD患者主要集中在6岁以下儿童,其中又以1~4岁较多,1岁组的发病率最高,随年龄的增长发病率逐渐降低,成年人群较少发病。男性发病人数明显多于女性发病人数,男女发病人数之比为1.45:1。发病人数最多的职业为散居儿童,其次是幼托儿童和学生,其他职业人群发病人数较少。5.2017~2018年,实验室诊断病例共2958例。2017年病原谱构成为:EVA71(56.22%),CV-A16(6.43%),其他EV(37.35%);2018年病原谱构成为:EV-A71(1.58%),CV-A16(27.70),其他EV(70.70%)。各月份和年龄组的优势病原体与当年的优势病原体一致。6.共分离出肠道病毒133株,其他EV中CV-A6所占比例最大,2017年占所有分离毒株的18.80%,2018年占15.26%。7.2018年CV-A6宁夏株与原型株之间的同源性低于2017年宁夏株与原型株之间同源性,说明宁夏地区的CV-A6还在不断进化中;通过遗传进化树分析,所有宁夏株均为D3a基因亚型。8.通过Simplot进行相似度和重组分析,发现宁夏流行的CV-A6毒株序列可能存在三种重组模式,EV-A114可能为序列的主要供体,但仍需进一步研究。结论1.宁夏回族自治区的HFMD多发于6岁以下散居儿童,以1岁组发病人数最多且发病率最高;呈现明显的季节性分布,夏秋季节高发,呈一主一次两个高发期,5~8月份为第一个发病高峰期,10~11月份为第二个发病高峰期;发病人数最多的为银川市。2.EV-A71和CV-A16仍然是宁夏回族自治区HFMD的主要病原体,二者交替占主导地位;CV-A6成为主要病原体之一。3.2017~2018年宁夏回族自治区流行的CV-A6毒株均为D3a基因亚型,且病毒仍在不断的进化中。4.宁夏回族自治区流行的CV-A6毒株可能存在三种重组模式,重组区域主要在2B区和3D区,EV-A114为重组序列的供体之一。