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在笼养条件下,鸟类会受到一系列环境的压力,如饮食结构、活动空间、人为干扰和病原体感染等,这些压力可能反映在鸟类的血液或其他组织的基因表达中。雌雄两性之间的表型差异是种内最大的变异,雌雄对这些压力的反应是否也存在差异?阐明这些应激反应的分子机制及其在雌雄间的表达差异将有助于改善饲养动物的福利。为此,本研究分别采集了同一环境下饲养的6雄5雌共11只东方喜鹊(Pica serica)的血液和毛囊组织,利用二代测序技术完成了样品的转录组测序与分析以探究笼养条件下东方喜鹊两性血液、毛囊的基因表达差异以及对环境压力反应的分子机制,结果如下:原始数据经处理分别产生大约100 Gb和58Gb(毛囊有2个样本测序失败)的高质量reads。经de novo组装,血液得到420,291条unigenes,毛囊得到434,967条unigenes,其中血液有 179,316 条 unigene,毛囊有 171,632 条 unigene 注释到了 nr、Swiss-prot、COG、KEGG四个数据库中。蛋白质数据库nr两种组织匹配到最多的物种是冠小嘴乌鸦(Corvus cornix Linnaeus)。血液、毛囊基因注释到COG中最多的功能是信号转导;GO中注释到最多的功能是结合;注释到KEGG最多的通路是信号转导通路。雌雄差异表达基因分析显示血液有2,657个unigenes存在显著差异表达(q<0.1),其中有1,607个是雄偏好表达基因,1,050个是雌偏好表达基因;毛囊有881个unigene存在显著差异表达(q<0.1),其中有239个是雄偏好基因,642个是雌偏好基因。差异表达基因GO功能富集分析以及KEGG通路富集分析显示,血液基因与细胞生长、能量代谢、免疫、应激反应功能显著相关;毛囊基因与细胞生长、发育、分化、黑色素合成等功能显著相关。其中,雌鸟血液偏好表达抗压力、能量敏感、免疫等相关基因;雄鸟毛囊偏好表达组织生长、发育、分化以及黑色素合成等相关基因。血液转录组与毛囊转录组比较发现,两种组织的基因表达模式只在少数方面相似。由结果可推测出的结论为:1.雌性东方喜鹊可能对环境压力、细胞能量变化敏感;面对环境压力,雌鸟可能上调表达抗压力基因以抵抗各种环境压力,并能较快速调节体内能量代谢适应环境变化。2.雄性东方喜鹊毛囊显著偏好表达组织生长、发育、分化以及黑色素合成相关的基因,表明雄鸟毛囊细胞可能有较快的生长速度、羽毛中有较多的黑色素;毛囊基因表达模式与血液基因表达模式差异较大。3.东方喜鹊两性存在性染色体基因剂量不平衡现象,剂量补偿为不完全补偿机制。