中国红皮砂梨遗传多样性及亲缘关系的SSR和AFLP分析

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红皮砂梨原产中国云南省及四川省的南部,具有良好的应用前景。迄今为止,缺乏对红皮砂梨品种和类型的遗传多样性评价和亲缘关系的研究,限制了对其合理利用。本研究采用SSR和AFLP标记技术,对原产中国西南的38个砂梨品种或类型做了鉴定,并对其遗传多样性和亲缘关系进行了分析,主要结果如下: (1)采用SSR标记技术对29个砂梨品种或类型做了鉴定,并对其亲缘关系进行了分析。6对SSR引物(BGA35、KU10、BGT23b、NH004a、NH011b和NH015a)均扩增出了较多的等位基因。NH004a位点的等位基因数、有效等位基因、杂合度和香农多样性指数都较高,显示了良好的品种鉴定能力。除3对品种或类型可能为同物异名或芽变类型无法区分开外,6对引物组合可以成功地鉴定其他品种。聚类分析可以将29个砂梨品种或类型明显分成四个组。第一组全部来自云南,其中包括两个绿皮砂梨品种,其余为红皮砂梨,说明该组内的红皮砂梨的祖先可能与这些绿皮砂梨亲缘关系很近。第二、三组包括四川会理的红梨品种和云南的一部分红梨品种。第4组包括来自四川会理的‘香酥梨’和‘栽秧梨’、原产云南弥渡的‘弥渡香酥梨’和原产云南丽江‘长水火把梨’,它们相互间及与其它梨的亲缘关系均较远。 (2)采用AFLP标记技术对38个砂梨品种进行研究。6对AFLP引物组合(EcoRI-AAG/MseI-CAT、EcoRI-ACT/MseI-CTT、EcoRI-AAC/MseI-CAG、EcoRI-AAC/MseI-CTA、EcoRI-AAC/MseI-CAA、EcoRI-AAG/MseI-CTC)总计获得443个位点,其中单态性位点87个,多态性位点356个,每对引物的多态率在76-85%之间,平均多态率为80%。引物组合EcoRI-ACT/MseI-CTT的扩增带数、多态性带数目、多态性比率、杂合度、香农多样性指数和标记指数都较高。6对引物组合可以成功地鉴定32个品种(含1对可能为同名异物的品种)。剩下3对品种或类型可能为同物异名或芽变类型无法区分开,这与SSR结果吻合。聚类结果表明,38个砂梨品种或类型可以分成五个组。第一、二组全部来自云南,其中包括6个绿皮砂梨品种,8个为红皮砂梨。第三、四组包括来自四川会理的红梨品种
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