进入21世纪,跨学科成为科技发展与学科创新的主导范式,跨学科的发展和创新成为能够解决全球问题的最有力的武器。世界各国都在制定政策和制度推动本国跨学科研究,美、日等发达国家的大学则进行了大量的探索和改革,尤其是一流研究型大学中的跨学科组织做出了很多开创性的研究工作并取得了令人瞩目的成绩。研究型大学是我国高等教育的主力军和知识创新的主体,承担着培养高素质复合型人才、创造高水平科研成果和促进社会进步与发展的重担。我国现有的研究型大学跨学科组织大都是在学校原有学科和院系的基础上成立起来的,在具体组织和运作过程中尚存在很多困难和障碍。本论文从分析跨学科、跨学科组织和研究型大学跨学科组织的内涵出发,通过考量当前我国研究型大学跨学科组织的发展历程和管理现状,研析出跨学科组织在运行管理中所存在的突出问题。随后以问题为导向,对MIT、东京大学、慕尼黑工业大学这三所国外一流研究型大学展开案例研究,在分析其跨学科组织运行的政策和制度环境的基础上,针对跨学科组织的结构和模式、平台构建、激励机制等方面进行探讨,得出相关启示。论文在问题分析和案例启示的基础上,提出了构建多种跨学科组织模式、建立较为全面的激励体系等完善我国研究型大学跨学科组织运行管理的具体对策。