论文部分内容阅读
目的hEXO1基因是唯一参与MMR系统的一种核酸外切酶,其在DNA的复制、修复、重组及染色体端粒的稳定过程起着十分重要的作用,hEXO1基因突变和失活均会促进肿瘤的发展,缩短肿瘤患者的生存时间。近些年来的研究表明,hEXO1基因多态性与肺癌、直肠癌、胃癌、乳腺癌及口腔癌等多种肿瘤的发生及发展均有相关性。本研究旨在探讨hEXO1基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)与肝细胞癌(hepatocellular carcinoma, HCC)遗传易感性及临床特征的关联研究。方法本研究首先通过生物信息学分析筛选hEXO1基因可能影响基因表达或基因功能的SNP。通过美国环境健康科学院(National Institute of Environmental Health Sciences, NIEHS)数据库筛选中国人群hEXO1基因最小等位基因频率(minor allele frequency, MAF)大于0.05的高频突变位点,筛选出hEXO1的3个位点:rs1047840(G>A)、rs1776148(G>A)、 rs3754093(G>A)。应用病例-对照方法,分别选取1199例无HCC患者作为对照组,1196例HCC患者作为病例组。选取hEXO1基因的rs1047840、rs1776148、rs3754093位点进行基因分型,采取TaqMan MGB实时荧光定量聚合酶链式反应(real-time fluorescent quantitative polymerase chain reaction,RT-PCR)进行基因分型。HCC发病风险与位点rs1047840、rs1776148、rs3754093单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)的相关性应用二分类Logistic回归模型进行分析,同时研究吸烟、饮酒、乙型肝炎病毒(Hepatitis B virus, HBV)感染等环境因素与位点rs1047840、rs1776148、rs3754093多态性的交互作用,并探讨rs1047840、rsl776148、rs3754093多态性与肝癌临床特征的关系。结果(1)患者的一般情况:两组患者的性别、年龄、民族差异均无统计学意义(均P>0.05);两组患者的饮酒史、吸烟史、HBV感染史及肝癌家族史等情况差异均有统计学意义(均P<0.001)。(2)对照组中Hardy-Weinberg遗传平衡定律检验结果:经Haploview4.2检验,对照组中hEXO1基因的rs1047840、rs1776148、rs3754093位点的基因型分布均符合HWE平衡。(3) rs1047840、rs1776148、rs3754093基因型分布与HCC发病风险的关系:rs1047840、rs1776148、rs3754093位点三种基因型AA、AG、GG在无HCC组及HCC组的分布差异均无统计学意义。对患者的一般情况进行调整后,经多因素Logistic回归分析,HCC发病与rs1047840、rs1776148位点SNPs在调整前后差异均无统计学意义(均P>0.05);而携带rs3754093突变型杂合子基因型(AG)的个体HCC发病风险降低。(4)分层分析:以吸烟史、饮酒史、HBV感染史及HCC家族史进行分层分析,结果显示,HCC发病风险与rs1047840、rs1776148位点SNPs均无统计学关联;在无吸烟史、无饮酒史、无HCC家族史个体中,携带rs3754093突变型杂合子基因型(AG)是保护因素,这些个体患HCC的风险明显降低。(5)基因与环境的交互作用:经二分类Logistic回归模型分析发现在HCC发病中rs1047840、rs1776148、rs3754093位点SNPs均与HBV感染史、饮酒史、吸烟史等环境因素存在交互作用(均P<0.05)。(6)基因与基因的交互作用:经二分类Logistic回归模型分析发现在HCC发病中rs1047840与rs3754093,rsl776148与rs3754093位点SNPs均存在基因-基因交互作用,两位点突变共同作用可降低HCC发病风险。(7) hEXO1基因多态性与肝癌临床特征的关系:经单因素卡方分析及多因素logistic回归校正了性别,年龄,民族,饮酒史,吸烟史,HBV感染情况及HCC家族史等因素后,均未发现rs1047840、rs1776148、rs3754093位点多态性与肿瘤大小、肿瘤数目、有无子灶、有无肝硬化、有无癌栓、有无被膜侵犯有关。结论rs3754093位点突变可能降低HCC发病风险。rs1047840、rs1776148、rs3754093位点与环境危险因素的交互作用与HCC发生有关。