现阶段中国经济增长的驱动力已经由依靠低成本劳动力和大规模资金投入的“粗放式”增长向一个新时期转变,这个新时期以全要素生产率的提升为主要任务。一方面坚持以创新、协调、绿色、开放、共享为主题的发展基调就强调了全要素生产率对于经济的高质量增长具有举足轻重的作用;另一方面党的十九大报告也表明,我国现在处于高质量发展时期,经济增长一定要有新的理念来指引,将经济增长向全要素生产率提升转变。在此背景下我国城市全要素生产率的提升就变得尤为重要。国家级高新区拥有着国家实现创新驱动发展目标的重要优势,不仅有助于经济的发展,还可以助力于城市全要素生产率水平的提升。因此,研究国家级高新区与城市全要素生产率之间的关系也就十分重要。本文采用了284个地级市的样本数据,使用双重差分法验证了2003年至2016年时间段国家级高新区对城市全要素生产率的影响,并重点探讨了国家级高新区通过创新效应和结构效应促进城市全要素生产率的影响机理。首先,本文通过实证验证了国家级高新区对城市全要素生产率具有显著的正向影响,没有设立国家级高新区的城市与设立了国家级高新区的城市满足平行趋势假定,国家级高新区在未来四年能显著助推城市全要素生产率水平的上升且效应显著。国家级高新区的政策影响效应在区域上:存在由东向西逐渐递增的特征;在城市规模上:大城市和小城市的影响效应略高于中等城市;在成长周期异质性上:成熟型高新区的影响效应大于成长型高新区。其次,本文分别从创新效应和结构效应两个角度验证了国家级高新区对城市全要素生产率的影响机制。研究表明:第一,国家级高新区能够通过创新效应促进城市全要素生产率的提升,更深层次地发现国家级高新区发挥创新效应是通过创新投入和创新产出来促使城市全要素生产率提升的,代表创新投入和创新产出的指标分别是科技费用投入、科学人才投入和专利发明。第二,国家级高新区可以通过发挥结构效应来促进城市全要素生产率的提升,具体而言是能够通过促进产业结构高级化来推动城市全要素生产率的提升。最后,结合本文理论和实证两个部分的研究结果得出,为了更好地发挥国家级高新区促进城市全要素生产率提升中的创新效应和结构效应,国家应该继续落实国家级高新区政策;依据各地具体情况分别制定政策;加强园区创新观念;增强产权保护意识;完善人才引进制度,提高人力资本和促进国家级高新区产业结构优化发展。