褐飞虱严重地影响了水稻种植，对每年的水稻生产造成极其巨大的经济损失。选育和利用抗褐飞虱水稻品种是防治该害虫最经济、有效的途径。为了明确水稻种质资源材料的褐飞虱抗性情况，筛选抗褐飞虱水稻新种质，鉴定抗褐飞虱基因，为水稻抗褐飞虱育种奠定基础。本试验利用苗期集团筛选法在对620份水稻种质材料进行抗性初步鉴定的基础上，挑选其中159份材料进行抗性重复鉴定，建立关联分析群体。利用109对多态性良好的SSR引物对群体的遗传多样性进行检测，利用PowerMarkerV3.25、NTSYSpc2.10e、SPAGeDi、STRUCTURE2.3.1对群体结构和亲缘关系进行分析，利用TASSEL2.1对SSR标记与褐飞虱抗性之间进行关联分析。主要结果如下：1、620份材料中，高感品种最多，占50.60%；高抗品种最少，占4.35%；中抗以上的品种约占34.65%。用于研究关联分析的159份材料中，有97份表现中抗以上，其中籼稻为75份，粳稻为22份。籼稻和粳稻在对褐飞虱抗性表现上有一定的差异。2、109对SSR引物对159份水稻品种进行遗传多样性检测，共扩增到等位基因554个，平均每个位点含5.1个等位基因，其等位基因变幅为2~11个，如RM1002(2)和RM3627(11)。基因多样性指数的变异范围为0.237~0.881，平均数为0.577。PIC值的变异范围为0.220(RM19)~0.869(RM3412)，平均值为0.530，表明SSR位点遗传多样性较丰富，为表型性状关联分析打下良好基础。3、NTSYS的聚类分析和群体结构分析的结果较为一致，可以将供试群体分为典型的籼稻和粳稻两个亚群。SPAGeDi软件对供试材料进行亲缘关系分析，得到一部分材料存在一定亲缘关系，且只有极少数有着较近亲缘关系。4、采用GLM(Q)、MLM(Q+K)和MLM(PCA+K)计算模型分别对两年褐飞虱抗性数据进行关联分析，共找到12个标记与群体褐飞虱抗性等级显著关联。其中分别位于1号染色体上的RM1195和RM3627、2号染色体上的RM7451、8号染色体上的RM72和RM6838在两年的表型数据的关联分析中都检测到。这些关联到的相同标记，说明其多态性位点的稳定性较好。与已发现的抗褐飞虱有关基因相比较，有4个标记与已知基因有较近距离。5、在12个与水稻褐飞虱抗性显著关联位点中，有9个位点既有增效等位变异又有减效等位变异。RM72-197的减效效应最大。只有3个等位变异对褐飞虱抗性性状具有增效效应。此外，同一份材料携带多个抗性等位变异。