《黄帝内经》(以下简称《内经》)最早论及命门,并明确指出眼睛为命门。而被人们公认为最早注释《内经》且部分理论根起于《内经》的《黄帝八十一难经》(以下简称《难经》),却给出了另外一种截然不同的解释——右肾为命门。眼睛与右肾可谓风牛马不相及。藉此,关于命门,后世医家展开了一场跨越千年的争论,并在此过程中产生了两肾命门、小心命门、命门相火,以及命火衰微病证和方药等一系列内容然而直到现代,命门依旧是一个困扰着中医学界的迷。本文通过分析命门问题的源起,古代以及近现代关于命门的各种观点,借用系统方法,将两肾与肚脐(神阙穴)、命门穴相连,将之连成个贯穿人体前后的矢状轴,即神阙穴——两肾——命门穴系统命门轴。两肾是系统命门的核心,内寄元阴元阳,产生命门相火,也就是肾间动气。神阙穴和命门穴作为系统命门统摄人体阴阳,向人体输布命门火气的两个关口,是生气外发的重要部位。并将系统命门置于人体大系统中,分析其与五脏六腑、十二经脉、奇经八脉的关系。以期望为命门更好更确切的应用于临床提供一种新的思路。本文主要论述以下几方面的内容1,命门问题的源起2,历代医家以及现代各家对命门的认识。3,系统、系统思想以及其在中医学中的体现和运用4,《内经》命门释疑,《难经》命门释疑。5,从系统角度论述命门,将肚脐(神阙穴)、两肾、命门穴纵观连成的一个贯穿人体前后的无形的轴,即神阙穴—两肾—命门穴系统命门轴,构成一个系统命门,作为人体生命的原动力6,人体大系统中,系统命门与五脏六腑、十二经脉、奇经八脉的关系