陆地棉纤维品质性状QTL有利等位基因鉴定

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棉花是世界上首要的天然纤维作物。中国为世界棉花消费第一大国,棉纺产业在我国国民经济中占重要地位。棉属包括45个二倍体种和5个异源四倍体种,其中有4个栽培种。棉花栽培种包括两个二倍体和两个四倍体种,它们分别是亚洲棉、草棉、陆地棉和海岛棉,陆地棉产量占世界棉花产量的95%以上。棉花纤维品质性状是受微效多基因控制的数量性状,与产量性状负相关且易受环境影响。传统育种对棉花纤维产量和品质的改良已经做出了贡献,然而这种育种方法进展缓慢,周期长且效率低。随着分子生物学和分子标记技术的发展,分子标记辅助选择为育种工作者提供了一种快速且准确的育种方法。本研究选择陆地棉高纤维强度品种渝棉1号和超长纤维品系TAM94L-25为作图亲本,建立了F2:6重组近交系群体,在构建陆地棉遗传连锁图谱的基础上,结合表型值对纤维品质性状QTL进行定位。研究结果如下:1、引物多态性分析本研究利用11439对SSR引物,对亲本渝棉1号和TAM94L-25进行引物多态性筛选,共获得398对多态性引物,多态性比例为3.5%。不同来源的SSR引物间的多态性比例有差异。其中PGML引物多态性比例最高,为6.7%,其次为DPL引物,占5.1%,DC引物多态性比例最低,仅为1.2%。2、F2:6群体标记基因型检测利用398对多态性引物对重组近交系群体的92个单株进行基因型检测,共获得标记位点406个,其中8对引物各产生2个位点。经卡方检测,406个位点中有69个偏离孟德尔1:1分离比例(P﹤0.05),偏分离位点占16.9%。3、陆地棉连锁图谱的构建对406个SSR标记位点进行遗传连锁分析,构建了包含357个标记的(渝棉1号×TAM94L-25)F2:6重组近交系遗传连锁图谱,该图谱覆盖长度为2143.2c M,标记间平均距离为6.0c M。根据现有图谱上已经确定染色体的标记,将60个连锁群定位到陆地棉26条染色体上。4、品质QTL有利等位基因鉴定利用(渝棉1号×TAM94L-25)F2:6重组近交系群体构建的遗传连锁图谱,结合2个环境(2014-2015年)的纤维品质表型数据,采用区间作图(interval mapping)法,共检测到11个纤维品质QTL,解释性状表型变异23.2-45.5%。包含4个纤维长度QTL,解释性状表型变异23.1-45.5%,其中3个增加纤维长度的有利等位基因来源于TAM94L-25,1个增加纤维长度的有利等位基因来源于渝棉1号;1个纤维整齐度QTL,解释性状表型变异30.8%,增加纤维整齐度的有利等位基因来源于TAM94L-25;3个纤维比强度QTL,解释性状表型变异12.2-37.6%,其中1个增加纤维比强度的有利等位基因来源于TAM94L-25,在两个环境中都可以检测到,为稳定的QTL。2个增加纤维比强度的有利等位基因来源于渝棉1号;1个纤维伸长率QTL,解释性状表型变异12.1%,增加纤维伸长率的有利等位基因来源于TAM94L-25;2个纤维马克隆值QTL,解释性状表型变异10.1-17.3%,其中q FM10.1表现为渝棉1号的等位基因增加性状表型值,q FM14.1表现为TAM94L-25的等位基因增加性状表型值。
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