自国家科技创新战略实施以来,如何构建完善的科技创新体系以及准确定位科技创新主体已经成为推进科技创新战略顺利实施的基础条件。国家科技创新战略规划书中明确提到,要建设高效协同的国家创新体系,并且明确要求要增强企业的创新主体地位和主导作用,发挥科研机构的技术引领作用,发挥高校的基础和生力军作用。从科技创新主体切入,运用协同学理论对高校、科研机构、企业等主体的演化进行分析,确定企业的创新主体地位,激发各类主体的创新活力,使各主体协同互动,提升创新能力。以协同学理论与科学技术哲学为视角,以山西省晋城市的农业科技创新主体为例,分析晋城市各农业科技创新主体的综合创新能力,确立以农业企业为核心创新主体。对农业科技创新主体研究国内外现状和未来的发展趋势进行了分析,确立创新主体的概念及企业为创新主体的理论依据。首先对科技创新主体的概念做了准确定位然后分析各个主体的功能及创新能力分析。其次基于协同学序参量理论对科技创新主体展开分析。主要对当前农业形势下,农业科技创新主体的选择进行理论分析。对企业成为农业科技创新主体的必然性加以说明。针对晋城市当前农业科技创新的现实状况进行阐述,分析了晋城市典型企业的发展过程,,并且分析了企业成为农业科技创新主体的优势。通过对晋城市企业整体数据的分析,就晋城市农业科技创新企业的创新能力而言,属于山西省内创新能力较差的地区,表现为科技创新基础弱,科研资金投入不足,科技创新人才短缺等的几点。最后通过对晋城市涉农企业存在的问题给出企业自身从内部通过弥补自身短板,提升创新能力将企业培育为农业科技创新主体的措施,以及政府通过外部干预科技创新的政策手段来巩固企业成为农业科技创新主体的核心地位。