随着经济全球化程度的提高，世界经济发展的区域化特征也越发明显，创新能力也成为各个区域竞争优势的决定因素。但是，区域经济发展实际的差异表明，不同区域的创新效率存在着重大差别，而南京市正处于城市化加速以及国际化提升的关键时期，科技创新能力以及科技与金融的结合程度起着非常关键的作用。本文通过理论研究、博弈论模型及案例研究相结合的方法，对服务于南京技术创新的科技金融生态链进行了系统的剖析。首先，本文基于国内外关于区域创新能力以及三螺旋模型等理论基础，分析了南京市在科技金融生态链建设中存在的问题以及国外科技金融服务体系的发展；第二，运用博弈模型对科技金融生态链中的主体，包括企业、政府、学研方及投资机构间的关系进行了进一步的分析；第三，在对博弈结果分析的基础上，研究了南京科技金融生态链的运作机制，并提出了相关的政策建议。通过本研究，得出以下结论：第一，南京市科技创新能力不高，科技成果转化率较低的原因来自于科技金融生态中企业、政府、高校与科研机构等主体间的交互影响能力不强，运用三螺旋模型的思想加强三者的交互作用，切实提高创新能力；第二，要重视科技金融生态链中的各个参与主体，厘清各方的利益关系，优化金融生态链的成长环境；第三，科技金融生态链的建设依赖于政府部门的扶持和监督，完善社会信用体制，健全的法律政策等有利于科技金融生态链的进一步发展。