水稻(Oryza sativa L.)是世界上重要的粮食作物之一，世界上有一半的人口以稻米为食。干旱是影响产量的重要非生物胁迫之一。近些年，我国城镇化进程的加快，更是加剧了我国水资源的短缺，因此，研究节水抗旱稻至关重要。根系是水稻重要的吸水器官，较深的根系分布层可以增加水稻的吸水量，提高水稻的避旱性。对控制深根比基因的精细定位，能够帮助我们揭示抗旱机理，加快节水抗旱稻选育进程，同时对保障我国粮食安全也具有重要意义。　　本实验室自2004年以来利用珍汕97B与IRAT109构建重组自交系(RecombinantInbred Lines，RIL)群体，并利用213个SSR分子标记构建了覆盖全基因组的图谱。通过多年多点鉴定，共检测到四个深根比主效QTL，分别位于第1、2、4、7号染色体。通过回交，结合目标QTL连锁标记前景选择和全基因组背景选择，构建以珍汕97B为背景，含有目标QTL的4个近等基因系(Near Isogenic Line，NIL)。在此基础上，本文针对位于第2号染色体上深根比主效QTL-qRDR-2进行了精细定位，结果如下:　　1.BC4F1前景与背景检测:本实验室于2015年春，完成含有目标QTL-qRDR-2的BC4F1构建，结合前景连锁标记及背景标记基因型检测，选择目标区段连锁标记基因型双杂合，背景与珍汕97B尽量相似单株，在63个BC4F1中共筛选出32个单株。　　2.qRDR-2重组交换单株的筛选及重组交换位置的确定:将含有目的片段的近等基因系BC4F1发展为含有8000株的BC4F2群体，利用初定位区间两侧连锁标记RM6与RM240进行重组交换单株的筛选，共筛选出289株重组交换单株。通过分析重组交换单株目标区段标记基因型，发现其中14个标记发生重组，包括22个重组交换单株。　　3.qRDR-2精细定位:本课题于2016年6月，将22个重组交换单株的自交后代种植于上海金山廊下基地，每个重组交换单株种植42个BC4F3单株。利用“篮子法”对每个单株进行表型鉴定，并结合基因型检测，将QTL-qRDR-2定位于分子标记Q2-323与Q2-12之间，物理距离为570kb。　　4.第二次重组交换单株的筛选及重组交换位置的确定:为了进一步缩小区间距离，在第一次定位的基础上，利用QTL区间两侧连锁标记Q2-323与Q2-12，从4000个F4单株中，筛选出106个重组交换单株。通过分析重组交换单株目标区段标记基因型，发现其中6个标记发生重组，共包括12个重组交换单株。　　5.候选基因预测:通过生物信息学分析，并结合本实验室根尖RNA-seq数据，在目标区段预7个候选基因:LOC_Os02g48360、LOC_Os02g48710、LOC_Os02g48770、LOC_Os02g49160、LOC_Os02g49440、LOC_Os02g49460、LOC_Os02g49720，其中LOC_OS02g49160为已知基因OsPIN1。