通过深度测序对小细胞肺癌样本进行微小RNA的发现及表达分析

来源 :哈尔滨医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:windlian
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目的:挖掘与小细胞肺癌有关的miRNA,明确主要的miRNA在肺癌发生和进展过程中的作用。方法:应用小细胞肺癌和正常组织构建miRNA文库,应用solexa深度测序挖掘差异表达的miRNA,应用实时定量PCR检测这些miRNA在肺癌组织和细胞的表达,利用基因转染及构建动物模型研究主要的miRNA对肺癌生物学性质的影响。结果:solexa深度测序共发现81个差异表达miRNA。实时定量PCR结果显示检测的36个miRNA的表达趋势与solexa深度测序的结果一致。miRNA-30a-3p在小细胞肺癌与正常组织的表达差异达到0.19,实时定量PCR检测结果显示miRNA-30a-3p在小细胞肺癌组织和NCI-H449、SBC-5和NCI-H46细胞中呈低表达,转染含有miRNA-30a-3p质粒的NCI-H449细胞生长慢于未转染的NCI-H449细胞,流式细胞仪检测结果显示转染后细胞总的凋亡比例大于未转染细胞,细胞更多的被阻滞于G0/G1期。应用转染miR-30a-3p的NCI-H449细胞建立的裸鼠移植瘤结果显示转染miR-30a-3p的细胞和移植瘤组织的VEGF-C表达均低于未转染组,同时转染组的移植瘤组织的血管和淋巴管密度明显低于未转染组,转染组的移植瘤的生长慢于未转染组。结论:应用solexa深度测序技术成功获得了人小细胞肺癌miRNA表达谱,挖掘出81个差异表达的miRNA;miRNA-30a-3p在小细胞肺癌组织和细胞中呈低表达,高表达的miRNA-30a-3p能抑制小细胞肺癌细胞的增殖、促进凋亡和细胞周期阻滞;高表达的miRNA-30a-3p能间接地降低小细胞肺癌的VEGF-C表达,降低小细胞肺癌移植瘤组织的血管和淋巴管密度,抑制移植瘤的生长。
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