近年来,关于如何对高校的科研绩效进行科学、合理地评价,学者们做了很多相关的研究。但是,对高水平院校的某一特定学科的科研活动进行效率评价,在之前的高等教育评价中较少涉及。然而,不同学科的科研活动都有其自身的特点,在对大学科研进行评价时,应分别不同对象的特点,确定不同的评价内容与指标,采用不同的评价方法进行分类评价。985工科院校作为国家原创性科学研究及高新科研成果应用、转化的重要基地,其科研活动体现出明显的工科特色,并且具备一般工科院校难以比拟的科研优势;985工科院校的科研能力、科研成果的数量与水平,标志着我国先进科技文化的发展水平,也在一定程度上影响着我国综合国力的提升。因此,对985工科高校的科研投入产出效率进行科学、合理、准确地评价,不仅有利于规范科研管理,促进高校的科研发展,而且对充分发挥高水平工科院校的科技创新作用,提升我国的科技创新能力都具有重要意义。本文以985工科院校科研投入产出效率为评价对象,遵循分类评价的基本原则,结合985工科院校自身的特点与科研特色,构建起针对985工科院校科研投入产出效率评价的指标体系;并运用在高校科研评价中已广泛使用的数据包络分析(DEA)方法,对所选取的985工科院校的科研投入产出进行效率评价,得到相对于现有评价结果更能真实、准确地反映所选样本科研投入产出效率情况的评价结果,并通过对评价结果的分析,为科研投入产出效率较低的单位提出了具有针对性的改进建议。