专利制度的最主要特征之一就是专利技术的公开性。但把涉及国家安全或重大利益的专利申请也进行公开,就会损害国家安全。因此,世界上绝大数国家对涉及国家安全或重大利益需要保密的发明创造,都进行了特殊的法律规定,形成了各自不同的保密专利制度。我国根据申请专利的发明创造是否涉及国防利益,分别建立了国防专利制度和保密专利制度,以期通过最大限度平衡国防安全需要和维护国防专利权人利益,实现促进国防科学技术进步的目的。我国国防专利制度实施以来,取得了巨大的国防效益和经济效益。但从实践来看,仍然存在着诸多制度弊端。主要体现在:相对独立的国防专利申请机制给国防专利带来潜在的法律冲突,补偿制度实现不了补偿激励作用,国防专利权归属制度不明确,大量国防专利技术资源闲置浪费、转化实施成效不明显,侵权救济困难、难以有效维权。这些问题严重阻碍了国防科技的创新。分析原因,一方面是现行国防专利制度未能有效平衡和调和其固有的私权和公权、公开和保密这两对矛盾,另一方面是现行国防专利制度主要构建于上世纪八九十年代,已经不能完全适应当前国防科技工业的新变革、国防专利工作蓬勃发展的新局面。国防专利制度亟待进一步改革和创新。当前,我国正在依据新专利法对《国防专利条例》进行第二次修订,急需对国防专利制度的发展历史、运行状况等进行全面系统考察,研究分析问题,提出具体建议,从而为完善国防专利制度、进一步推动我国国防科学技术的发展与创新作出应有的贡献。基于上述考虑,本文主要研究了以下内容:一是研究分析了国防专利制度的保护对象、基本功能、内在矛盾和基本原则等基础理论问题。二是对我国国防专利制度的发展历史,现行法律体系、运行机制和主要特点,进行了客观并尽量全面的总结分析,指出了当前我国国防专利制度在专利申请、产权归属、转化实施、侵权救济等环节存在的法律空白、制度缺陷等问题。三是对国外国防专利制度的主要类型进行了全面考察,并与我国进行了比较分析,提出了可参考意见。四是着眼实现国家利益和国防专利权人的双赢目标,从建立国防科研项目全程管控制度、实现国防专利源头管理,完善产权激励制度、驱动技术创新,优化转化实施机制、提高转化效益,健全法律保护、强化服务保障等四个方面,研究提出了完善我国国防专利制度的具体建议。