LncRNA TCONS00041960阻止激素诱导大鼠BMSCs成脂分化并促进成骨分化的实验研究

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研究背景股骨头坏死(Osteonecrosis of the femoral head,ONFH)已成为临床常见疾病,在中国,估计有8百万人正遭受着股骨头坏死疾病的折磨,尤其是激素性股骨头坏死在非创伤性因素当中占首位,青壮年多见,往往造成双侧的股骨头塌陷,功能丧失甚至残疾,严重降低了患者的生活质量。目前,国内外仍没有确切有效的策略预防激素性ONFH的发生,最终患者不得不求助于手术一髖关节置换术来治疗ONFH,这无疑给患者家庭增加了负担,而且不确定的远期疗效,更是给社会增加了负担。科学技术发展到今天,人们对激素性股骨头坏死发病机制的认识仍没有达成一致,因此,深入研究激素性ONFH的分子机制,探索激素性ONFH的靶向防治方法具有重要科学意义与应用前景。在生命科学领域,有着生命世界“暗物质”之称的非编码RNA,越来越多地被发现参与多种生物进化过程,如细胞周期调控、胚胎发育和细胞分化等。有研究报道,微小 RNA(microRNA,miRNA)和长链非编码 RNA(long non-coding RNA,lncRNA)在调控骨髓间充质干细胞(BMSCs)异常分化(成骨成脂分化)过程中起着非常重要的作用。BMSCs异常分化是ONFH发生起始过程中至关重要的环节,预防激素性ONFH,除抑制BMSCs成脂分化关键基因PPARy外,促进其成骨分化也是关键,尤其是对成骨关键基因Runx2的调控。我们知道,ONFH的发生是多基因、多因素共同作用的结果。不同的分子之间存在着网络式调控,比如一个lncRNA或miRNA可以调控多个靶基因,而多个lncRNA或miRNA又可以同时调控共同的靶基因,lncRNA与miRNA、或者lncRNA之间均可能存在相互的调控关系。目前,在国内外文献中尚未见到采用lncRNA-miRNA-mRNA多靶向网络式调控BMSCs的成脂与成骨分化预防激素性ONFH的研究报道。因此,本研究旨在通过构建lncRNA-miRNA-mRNA的多靶向、网络式调控方式探讨ONFH疾病的发生发展及其防治,具有重要的科学意义和价值。研究目的通过基因芯片和生物信息学分析筛选出激素诱导BMSCs与正常BMSCs差异表达的lncRNA和miRNA,验证目标lncRNA与miRNA1及miRNA2的相互结合作用,并验证GILZ是miRNA1的靶基因、Runx2是miRNA2的靶基因;通过上调目标lncRNA表达,下调miRNA1和miRNA2表达,进而上调靶基因GILZ表达、抑制PPARγ表达,同时上调Runx2基因表达,达到阻止细胞成脂分化同时主动促进成骨分化的双倍高效作用。本研究选取了股骨头坏死关系较为密切的 lncRNA TCONS-00041960、miR-204-5p 和 miR-125a-3p 进行研究,并探讨lncRNA-miRNA-mRNA的多靶向、网络式调控BMSCs的异常分化预防激性ONFH的优势及其机制。本研究分为以下五个部分:第一部分:激素诱导BMSCs特异表达的lncRNAs和miRNAs分析方法:(1)制备大鼠BMSCs:从大鼠的胫骨和股骨提取原代BMSCs,体外培养至P3代,然后用流式细胞仪行表面抗原CD29、CD34、CD45和CD105进行鉴定。(2)激素诱导BMSCs分化:用106M地塞米松诱导BMSCs;诱导第7天,用油红“O”进行染色确认激素诱导成功。(3)筛选激素诱导BMSCs特异表达的lncRNAs和miRNAs:采用基因芯片检测地塞米松诱导大鼠BMSCs与正常大鼠BMSCs内lncRNAs和miRNAs的表达差异;(4)基因芯片结果验证和靶基因表达检测:随机选取2个lncRNAs和4个miRNAs,采用qRT-PCR检测激素诱导大鼠BMSCs中目标lncRNAs和miRNAs的表达水平,以及PPARγ、Runx2和GILZ的mRNA表达水平。(5)采用SPSS 17.0软件对数据进行处理,进行统计学分析。结果:(1)流式细胞仪检测结果显示:P3代大鼠BMSCs表达CD29、CD105,阳性率分别为99.76%,99.42%;CD34、CD45呈阴性,阳性率分别为1.23%,1.41%,得到高纯度的BMSCs。(2)激素诱导BMSCs分化结果显示:用106M地塞米松诱导BMSCs 7天,油红“O”染色结果示:Model组中出现大量脂滴,Control组未出现脂滴,说明激素诱导细胞模型成功。(3)基因芯片检测结果显示:激素处理Model组与Control组对比,差异2倍以上的有10个miRNAs上调,16个miRNAs下调;79个lncRNAs上调,72 个 lncRNAs 下调。(4)qRT-PCR结果显示:激素处理Model组与Control组对比,lncRNA TCONS00041960的表达水平明显下调,差异具有统计学意义(P<0.01),lncRNA TCONS00083120的表达水平明显上调,差异具有统计学意义(P<0.05);miR-204-5p和miR-125a-3p的表达水平明显上调,差异具有统计学意义(P<0.05),miR-146a-5p和miR-301a-3p的表达水平明显下调,差异具有统计学意义(P<0.05);而且成脂基因PPARy表达水平升高,差异具有统计学意义(P<0.05),GILZ和Runx2基因表达水平下降,差异具有统计学意义(P<0.05)。第二部分:上调lncRNATCONS00041960对激素诱导的BMSCs分化的影响方法(1)构建过表达lncRNA TCONS00041960(Ex-Lnc)重组慢病毒和无关序列对照lncRNA TCONS00041960(Ex-NC)重组慢病毒,建立上调lncRNA TCONS00041960 的 BMSCs。(2)实验分四组:Blank组(空白组)、Dex组(激素诱导组)、Ex-Lnc+Dex组(激素诱导且过表达lncRNA TCONS00041960组)、Ex-NC+Dex组(激素诱导且过表达lncRNA TCONS00041960无关序列对照组)。(3)lncRNA TCONS00041960影响激素诱导的BMSCs分化:采用qRT-PCR 检测 Ex-Lnc+Dex 组和 Ex-NC+Dex 组中 lncRNA TCONS00041960 表达水平,确认感染是否成功;用10-6M地塞米松诱导Dex组、Ex-Lnc+Dex组和Ex-NC+Dex 组 BMSCs 14 天,分别采用 qRT-PCR 和 Western blot 检测大鼠BMSCs中成骨相关基因Runx2、Osterix和Osteocalcin的表达水平,以及成脂相关基因PPARγ、C/EBPα和GILZ的表达水平;同时检测细胞内甘油三酯含量(TG)和碱性磷酸酶(ALP)活性,并进行油红“O”染色。(4)采用SPSS 17.0软件对数据进行处理,进行统计学分析。结果(1)成功构建过表达lncRNA TCONS00041960(Ex-Lnc)重组慢病毒和无关序列对照lncRNA TCONS00041960(Ex-NC)重组慢病毒,慢病毒滴度分别为 1×108TU/ml 和 5×108TU/ml,成功建立上调的 lncRNA TCONS00041960的 BMSCs,感染系数(Multiplicity of infection,MOI)=2。(2)对比Dex组(激素诱导组)和Ex-NC+Dex组(激素诱导且过表达lncRNA TCONS00041960无关序列对照组),Ex-Lnc+Dex组(激素诱导且过表达lncRNA TCONS00041960组)中的lncRNA TCONS00041960表达水平显著升高,差异具有统计学意义(P<0.01)。提示慢病毒感染成功。(3)Ex-Lnc+Dex 组中,成骨相关基因 Runx2、Osterix 和 Osteocalcin 的基因表达水平和蛋白表达水平显著高于Dex组和Ex-NC+Dex组,差异具有统计学意义(P<0.05);成脂相关基因PPARγ、C/EBPα的基因和蛋白表达水平显著低于Dex组和Ex-NC+Dex组,差异具有统计学意义(P<0.05),而PPARγ抑制剂GILZ的基因和蛋白表达水平高于Dex组和Ex-NC+Dex组,差异具有统计学意义(P<0.05)。说明上调TCONS00041960可以抑制激素诱导大鼠BMSCs的成脂分化并促进成骨分化。(4)油红“O”染色中,可见Ex-Lnc+Dex组中的脂滴聚集明显少于Dex组和Ex-NC+Dex组,而且Ex-Lnc+Dex组中的甘油三酯(TG)含量也明显低于Dex组和Ex-NC+Dex组,差异具有统计学意义(P<0.05);碱性磷酸酶活性(ALP),Ex-Lnc+Dex组明显高于Dex组和Ex-NC+Dex组,差异具有统计学意义(P<0.05)。第三部分:下调miR-204-5p和miR-125a-3p对激素诱导的BMSCs分化的影响方法(1)合成 miR-204-5p Inhibitor 和 miR-125a-3p Inhibitor,miR-204-5p negative control和miR-125a-3p negative control,并采用脂质体转染法将其分别转入BMSCs 中。(2)实验分组:Blank组(空白组)、Dex组(激素诱导组)、NC+Dex组(激素诱导且无关序列对照组)、miR-204-5p Inhibitor+Dex组(激素诱导且转染 miR-204-5p Inhibitor)、miR-125a-3p Inhibitor +Dex 组(激素诱导且转染miR-125a-3p Inhibitor)。(3)miR-204-5p和miR-125a-3p影响激素诱导的BMSCs分化:采用qRT-PCR分别检测五组中miR-204-5p和miR-125a-3p表达水平,确认转染是否成功;用 10-6M 地塞米松诱导 Dex 组、NC+Dex 组、miR-204-5pInhibitor+Dex 组、miR-125a-3p Inhibitor+Dex 组 BMSCs 14 天,分别采用 qRT-PCR 和 Western blot检测大鼠BMSCs中成骨相关基因Runx2、Osterix和Osteocalcin的表达水平,成脂相关基因PPARγ、C/EBPα和GILZ的表达水平;同时检测细胞内甘油三酯含量和碱性磷酸酶(ALP)活性,并进行油红“O”染色。(4)采用SPSS 17.0软件对数据进行处理,进行统计学分析。结果(1)qRT-PCR 检测结果显示:miR-204-5p Inhibitor 组中的 miR-204-5p 表达水平显著低于Dex组和NC+Dex组,差异具有统计学意义(P<0.05);miR-125a-3p Inhibitor 组中的 miR-125a-3p 表达水平显著低于 Dex 组和 NC+Dex组,差异具有统计学意义(P<0.05),提示转染成功。(2)在 miR-204-5p Inhibitor 组中,成骨相关基因 Runx2、Osterix 和Osteocalcin的基因和蛋白表达水平显著高于Dex组和NC+Dex组,差异具有统计学意义(P<0.05);在 miR-125a-3p Inhibitor 组中,成脂相关基因 PPARγ、C/EBPα的基因和蛋白表达水平显著低于Dex组和NC+Dex组,差异具有统计学意义(P<0.05);而PPARγ抑制剂GILZ的基因和蛋白表达水平高于Dex组和NC+Dex组,差异具有统计学意义(P<0.05)。(3)油红“O”染色中,miR-125a-3pInhibitor组中的脂滴聚集明显少于Dex组和NC+Dex组,而且miR-125a-3p Inhibitor组中的甘油三酯(TG)含量也明显低于Dex组和NC+Dex组,差异具有统计学意义(P<0.05);碱性磷酸酶活性(ALP),miR-204-5p Inhibitor组明显高于Dex组和NC+Dex组,差异具有统计学意义(P<0.05)。第四部分:LncRNATCONS00041960通过双靶向调控miR-204-5p和miR-125a-3p抑制激素诱导大鼠BMSCs成脂分化同时促进成骨分化方法(1)实验分组:Blank组(空白组)、Dex组(激素诱导组)、Ex-Lnc+Dex组(激素诱导且过表达 lncRNA TCONS00041960 组)、miR-204-5p Inhibitor+Dex组(激素诱导且转染 miR-204-5p Inhibitor 组)、miR-125a-3p Inhibitor+Dex 组(激素诱导且转染miR-125a-3p Inhibitor组),通过qRT-PCR分别检测各组中miR-204-5p和miR-125a-3p的表达水平,以及检测成骨相关基因Runx2、Osterix和Osteocalcin的表达水平,成脂相关基因PPARγ、C/EBPα和GILZ的表达水平。(2)合成miR-204-5pmimic和miR-125a-3pmimic,并采用脂质体转染法将其分别转入大鼠BMSCs中。(3)通过检测Blank组(空白组)、Dex组(激素诱导组)、Ex-Lnc+Dex组(激素诱导且过表达 lncRNA TCONS00041960 组)、miR-125a-3p mimic+Dex组(激素诱导且转染 miR-125a-3pmimic 组)、Ex-Lnc+miR-125a-3pmimic+Dex组(激素诱导且过表达 lncRNA TCONS0041960 和转染 miR-125a-3p mimic)五组中的甘油三酯含量(TG)来研究lncRNATCONS00041960与miR-125a-3p的相互关系;通过检测Blank组(空白组)、Dex组(激素诱导组)、Ex-Lnc+Dex组(激素诱导且过表达 lncRNA TCONS00041960 组)、miR-204-5p mimic+Dex组(激素诱导且转染 miR-204-5p mimic 组)、Ex-Lnc+miR-204-5p mimic+Dex组(激素诱导且过表达lncRNA TCONS00041960和转染miR-204-5p mimic)五组中的碱性磷酸酶活性(ALP)来研究lncRNA TCONS-00041960和miR-204-5p的相互关系。结果(1)Ex-Lnc+Dex 组与 Dex 组相比,miR-204-5p 和 miR-125a-3p 的表达水平均降低,差异具有统计学意义(P<0.05)。在Ex-Lnc+Dex组和miR-204-5p Inhibitor+Dex组中成骨相关基因Runx2、Osterix和Osteocalcin的表达水平均高于Dex组,差异具有统计学意义(P<0.05);Ex-Lnc+Dex组和miR-125a-3p Inhibitor+Dex组与Dex组相比,成脂相关基因PPARγ、C/EBPα显著降低,GILZ明显升高,差异具有统计学意义(P<0.05)。提示上调lncRNATCONS00041960与下调miR-204-5p和miR-125a-3p对激素诱导BMSCs异常分化作用一致。(2)qRT-PCR检测结果显示:miR-204-5p和miR-125a-3p表达水平显著高于Dex组和NC+Dex组,差异具有统计学意义(P<0.01)。提示miR-204-5p mimic和 miR-125a-3p mimic 转染成功。(3)大鼠BMSCs的碱性磷酸酶活性(ALP)结果显示:与Dex组相比,Ex-Lnc+Dex组中的碱性磷酸酶活性(ALP)升高,差异具有统计学意义(P<0.05);miR-204-5pmimic+Dex组中的碱性磷酸酶活性(ALP)下降,差异具有统计学意义(P<0.05);但是在 Ex-Lnc+miR-204-5pmimc+Dex 组中,大鼠 BMSCs 的碱性磷酸酶活性(ALP)下降,差异具有统计学意义(P<0.05),提示lncRNA TCONS00041960通过负调控miR-204-5p来影响大鼠BMSCs的成骨分化。甘油三酯含量(TG)结果显示:与Dex组相比,Ex-Lnc+Dex组中的甘油三酯含量(TG)下降,差异具有统计学意义(P<0.05);miR-125a-3pmimic+Dex组中的甘油三酯含量(TG)升高,差异具有统计学意义(P<0.05);但是Ex-Lnc+miR-125a-3pmimic+Dex组中的甘油三酯含量(TG)升高,差异具有统计学意义(P<0.05),提示 lncRNATCONS00041960 通过负调控 miR-125a-3p来影响大鼠BMSCs的成脂分化。第五部分:LncRNA TCONS00041960通过双靶向调控miR-204-5p和miR-125a-3p抑制激素诱导大鼠BMSCs成脂分化同时促进成骨分化机制的初步研究方法(1)应用TargetScan与miRanda网站进行生物信息学分析,预测lncRNA TCONS00041960 潜在相互作用的 miRNAs,以及 miR-204-5p 和 miR-125a-3p的靶基因。(2)构建lncRNA TCONS00041960野生型荧光素酶双报告载体(pmirGLO-TCONS00041960-WT)和Seed Region突变型荧光素酶双报告载体(pmirGLO-TCONS00041960-MUT),分别与 miR-204-5pmimic 和 miR-204-5p NC 共转染入 HEK 293T 细胞,与 miR-125a-3p mimic 和 miR-125a-3p NC 共转染入HEK 293T细胞,通过双荧光素酶报告证实TCONS00041960与miR-204-5p或与miR-125a-3p存在相互作用。(3)通过免疫共沉淀技术(RNA immunoprecipitation,RIP),处理 BMSCs,利用A/G磁珠,形成与目的抗体Ago2结合的RNA复合物免疫共沉淀(实验组)和阴性对照抗体IgG结合的RNA复合物免疫共沉淀(对照组),进一步分离含有目标 lncRNA TCONS00041960、miR-204-5p 和 miR-125a-3p 的 RNA 复合物,纯化RNA后,通过采用qRT-PCR检测RNA复合物中lncRNA TCONS00041960、miR-204-5p和miR-125a-3p在实验组和对照组中的表达水平,证实TCONS00041960 与 miR-204-5p 或与 miR-125a-3p 存在相互作用。(4)制备分别载有 TCONS00041960-WT 和 TCONS00041960-MUT 的生物传感芯片,通过表面等离子共振技术(surface plasmon resonance technology,SPR),分别检测 TCONS00041960-WT 与 miR-204-5p mimic 和 miR-204-5p negative control 的反应值,TCONS00041960-WT 与 miR-125a-3p mimic 和miR-125a-3p negative control 的反应值;分别检测 TCONS00041960-MUT 与miR-204-5p mimic 和 miR-204-5p negative control 的反应值,TCONS00041960-MUT 与 miR-125a-3p mimic 和 miR-125a-3p negative control 的反应值,证实TCONS00041960 与 miR-204-5p 或与 miR-125a-3p 存在相互作用。(5)大鼠 BMSCs 中,研究 miRNAs(miR-204-5p 或 miR-125a-3p)对 lncRNA TCONS00041960 的影响:实验分五组:miR-NC 组(miRNA negative control),miR-204-5p mimic组(转染miR-204-5p mimic),miR-125a-3p mic组(转染miR-125a-3p mimic),miR-204-5p Inhibitor 组(转染 miR-204-5p Inhibitor),miR-125a-3p Inhibitor 组(转染 miR-125a-3p Inhibitor),通过 qRT-PCR 检测lncRNA TCONS00041960 的表达水平。(6)大鼠 BMSCs 中,研究 lncRNA TCONS00041960 对 miRNAs(miR-204-5p或miR-125a-3p)的影响:实验分四组:Ex-NC组(过表达lncRNA TCONS00041960无关序列对照组)、Ex-Lnc组(过表达lncRNA TCONS00041960 组)、si-NC 组(lncRNA TCONS00041960 抑制剂无关序列对照组)、si-Lnc 组(抑制 lncRNATCONS00041960 表达组),通过 qRT-PCR分别检测miR-204-5p和miR-125a-3p的表达水平。(7)构建双报告基因重组载体pmirGLO-WT 3’UTR-Runx2和pmirGLO-MUT 3’UTR-Runx2,分别与 miR-204-5p mimic 和 miR-204-5pNC 共转染入HEK 293T细胞;构建双报告基因重组载体pmirGLO-WT 3’UTR-GILZ和pmirGLO-MUT 3’UTR-GILZ,分别与 miR-125a-3p mimic 和 miR-125a-3p NC 共转染入HEK 293T细胞。采用双荧光素酶报告证实Runx2是miR-204-5p的靶基因、GILZ是miR-125a-3p的靶基因。通过Western blot技术分别检测Runx2在转染 miR-204-5p mimic 和 GILZ 在转染 miR-125a-3p mimic 的大鼠 BMSCs 中的蛋白表达水平。结果(1)TargetScan与miRanda生物信息学分析结果显示lncRNA TCONS00041960 与 miR-204-5p 和 miR-125a-3p 存在特异结合位点;Runx2 是 miR-204-5p的潜在靶基因、GILZ是miR-125a-3p的潜在靶基因。(2)双荧光素酶报告结果显示lncRNA TCONS00041960与miR-204-5p和miR-125a-3p 存在相互作用;Runx2 是 miR-204-5p 的靶基因,GILZ 是 miR-125a-3p的靶基因。(3)RNA 免疫共沉淀实验结果显示 lncRNATCONS00041960、miR-204-5p和miR-125a-3p在实验组Ago2抗体复合物中的表达水平明显高于对照组IgG抗体复合物中的表达水平,差异具有统计学意义(P<0.01)。(4)表面等离子共振实验结果显示TCONS00041960-WT与miR-204-5p mimic 反应值明显高于 TCONS00041960-WT 与 miR-204-5p negative control、TCONS00041960-MUT 于 miR-204-5p mimic、TCONS00041960-MUT 与miR-204-5p negative control 的反应值;TCONS00041960-WT 与 miR-125a-3p mimic 反应值明显高于 TCONS00041960-WT 与 miR-125a-3p negative control、TCONS00041960-MUT 与 miR-125a-3p mimic、TCONS00041960-MUT 与miR-125a-3p negative control 的反应值;说明 lncRNA TCONS00041960 与miR-204-5p 和 miR-125a-3p 存在相互作用。(5)与 miR-NC 组相比,miR-204-5p mimic 组和 miR-125a-3p mimic 组中的lncRNATCONS00041960表达水平下降,差异具有统计学意义(P<0.05),miR-204-5p Inhibitor 组和 miR-125a-3p Inhibitor 组中 lncRNA TCONS00041960表达水平升高,差异具有统计学意义(P<0.05),说明miRNAs(miR-204-5p或 miR-125a-3p)对 lncRNA TCONS00041960 有调控作用。(6)Ex-Lnc 组与 Ex-NC 组相比,miR-204-5p 和 miR-125a-3p 的表达水平下降,差异具有统计学意义(P<0.01);si-Lnc组与si-NC组相比,miR-204-5p和miR-125a-3p的表达水平上调,差异具有统计学意义(P<0.05)。说明lncRNA TCONS00041960 能够影响 miRNAs(miR-204-5p 或 miR-125a-3p)的表达水平。(7)Westernblot结果显示与空白组和转染miRNC相比,转染miR-204-5p mimic的Runx2蛋白表达水平下降,转染miR-125a-3p mimic的GILZ蛋白表达水平下降。说明miR-204-5p可以调控Runx2的蛋白表达水平,miR-125a-3p可以调控GILZ的蛋白表达水平。结论1.激素诱导的大鼠BMSCs成脂分化中,差异表达2倍以上有10个miRNAs上调,16 个 miRNAs 下调;79 个 lncRNAs 上调,72 个 lncRNAs 下调。lncRNA TCONS00041960 显著低表达,miR-204-5p 和 miR-125a-3p 显著高表达。2.上调 lncRNA TCONS00041960 的表达以及下调 miR-204-5p 和miR-125a-3p的表达可以有效抑制激素诱导的大鼠BMSCs的成脂分化,同时促进成骨分化。3.LncRNA TCONS00041960 通过负调控 miR-204-5p 调控 Runx2 的表达,负调控miR-125a-3p调控GILZ的表达,进而达到阻止大鼠BMSCs成脂分化同时主动促进成骨分化的作用。4.LncRNA-miRNA-mRNA多靶向网络式调控大鼠BMSCs的异常分化,有望成为研究防治ONFH新靶点。
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