运用蛋白质组学技术研究结肠组织、腺瘤与腺癌组织的差异表达蛋白

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本研究以结肠正常组织、腺瘤组织、腺癌组织为研究对象,进行双向电泳和质谱分析,初步筛选结肠腺癌与正常组织、腺瘤组织的差异蛋白质,寻找更加精确、有效的分子标志物,以期早期发现肿瘤、对肿瘤进行个性化治疗从而改善患者预后。 我们先通过对手术时获取的结肠癌组织标本进行预实验。以不同实验参数,即蛋白质裂解液体积比、蛋白质沉淀提取等方法提取结肠癌组织总蛋白质,采用24cm、Ph4—7的IPG胶条进行第一向等电聚焦,12.5%的SDS-PAGE进行第二向电泳分离蛋白后,用分析软件对图谱进行分析,结果显示在组织和蛋白质裂解液的质量体积比为1:10,用丙酮结合无水乙醇法清洗蛋白质,蛋白质上样量100μg,得到的结肠癌总蛋白质的双向电泳图像重复性好,显示蛋白质分离清晰,没有明显的条带。 在此基础上,我们利用得到的优化实验条件,对正常结肠组织、结肠腺瘤、结肠腺癌提取总蛋白,并进行胶内差异双向电泳分离,电泳后的凝胶用CyDye进行染色,图像扫描后应用分析软件对电泳图谱进行分析,建立正常组织、腺瘤组织、腺癌组织的蛋白质差异表达图谱。我们发现两两间差异表达变化超过2倍的蛋白点有31个。在此基础上,采用自动凝胶采样系统对差异表达的蛋白点进行自动采集,应用特异性的胰酶消化蛋白质,酶解后的肽段用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)进行分析,对获得的原始数据通过SEQIJEST软件搜索SWISS-PROT的人非冗余蛋白质序列数据库,在31个差异表达的蛋白点中,鉴定了24个蛋白质,其中Beta-Tropomyosin(TMβ)首次发现在结直肠腺癌组织表达明显下降。从功能分析,这些差异蛋白质与癌细胞的发生、增殖、分化、转移等相关。 为了保证初筛结果的可信、进一步研究差异表达蛋白质的表达趋势,并探讨差异表达蛋白Beta-Tropomyosin(TMβ)、Transglin(SM 22)在结肠癌的表达情况及在疾病发展中的作用,我们运用蛋白质免疫印迹方法(Western—Blot)检测它们在正常组织、腺瘤、腺癌中的相对含量。 通过对以上的实验结果进行分析,我们得出如下结论: 1.运用双向凝胶电泳可以有效分离结肠正常组织、腺瘤组织、腺癌组织的蛋白质;并能应用此方法获得正常组织、腺瘤组织、腺癌组织之间的差异表达蛋白质。 2.通过对差异表达的蛋白质进行的MALDI-FOF-MS分析方法分析,获得了24个蛋白质。其中TMβ首次发现在结直肠腺癌组织表达明显下降。 3.蛋白质免疫印迹方法检测表明,与正常结肠组织相比,腺瘤组织及肿瘤组织中TM β、SM 22表达均明显下降,结果与双向电泳一致。 4.TM β是致癌基因Ras基因下游的一个作用位点,表现出抑制肿瘤活性;其表达下降可能与结肠癌的发展、发展有关; 5.本研究发现SM 22表达下调,可能与肿瘤发生时引起平滑肌层、血管、成肌纤维细胞的异常改变有关。
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