新疆优质细毛羊遗传多样性及羊毛细度侯选基因的分析

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新疆是我国细毛羊饲养基地,近年,多种原因指使新疆的细毛羊饲养业连年滑坡,进口毛量增大,而目前国内外毛纺产品已经向轻薄、柔软、挺括、高档方向发展,在羊毛品质方面也出现了划时代的变革,主要表现在羊毛细度上。为此我们必须培育出符合市场需求的细型羊只。本实验分为两部分,第一部分是利用9 个微卫星标记,采用PCR 扩增,8%的聚丙烯酰胺凝胶电泳,对96 只优质细毛羊基因组DNA 的遗传多样性进行了检测。第二部分是采用PCR-SSCP 的标记技术,选择羊毛纤维组成蛋白中的KAP1.1、KAP1.3 的部分序列、KAP6.1 的外显子区作为侯选基因,通过对其多态性的研究,探索将该基因作为侯选基因来间接选择羊毛细度性状的可行性。结果表明,9 个微卫星位点多态信息含量除了G54279 为中度多态性外,其余均为高度多态性;群体的平均多态信息含量(PIC)为0.7250、遗传杂合度(h)为0.7437 和有效等位基因数(Ne)为4.4 均高于国内外部分研究结果。证明8 个微卫星位点可以作为有效的遗传标记用于优质细毛羊的遗传多样性分析。侯选分析得出其中在角蛋白辅助蛋白的多基因家族中的高硫蛋白辅助蛋白(KAP1.1、KAP1.3)中,位点W08667 与羊毛细度有显著的相关性。在甘氨酸酪氨酸角蛋白辅助蛋白中,外显子位点W06933的AA 基因型和BB 基因型对羊毛细度之间有显著的相关性(P<0.05)。对于引物W08667 中的BB 基因型和原来的序列相比较,没有发现单碱基的变化。而CC 基因型发现三处碱基突变,分别是:A+269处的C 突变为T、A+369 处的C 突变为T、A+385 处T 突变为C。引物W08669 中的AB 基因型也没有碱基的变化。而AA 基因型发现了两处突变,分别是:A+76 处C 突变为T、A+168 处G 突变为A。对W07399 两个个体同是AB 基因型进行了测序,发现与原来序列比较只有一处发生了碱基突变:C 突变为T。W08673 中的AA 基因型、AB 基因型与原序列比较发现,它们不象前面几个引物为碱基突变,而是都被碱基插入,从而使得碱基序列发生变化。
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