肽组学是对体液中的肽段(分子量小于50kD)进行综合的定性及定量分析的研究，肽组学的提出为我们提供了一种新的思路，获取反映体液样品蛋白构成特征的肽表达谱，对降解过程中的蛋白产物，以及蛋白前体中释放的片段进行分析，可能会发现新的生物标志物或新的诊断方法。 基于质谱技术的体液肽表达谱分析技术的提出使得对体液中全部肽段/蛋白质的分析鉴定成为可能，通过同时检测疾病患者与健康对照之间的体液肽表达谱，对比结果，找出差异，有可能找到特定疾病的特异标志物或发现新的疾病相关蛋白，为疾病的诊断或治疗提供依据，也可能为进一步阐明疾病的发病机制提供参考。将质谱分析应用到临床诊断是一个重要的机遇，促进了体外诊断的发展研究，进行基于质谱的诊断研究有望在将来实现体外诊断注册。 由于胰腺位置隐蔽，胰腺癌临床症状不典型，同时又缺少敏感和特异性的诊断指标，导致胰腺疾病胰腺癌的早期诊断极为困难，严重威胁人类的健康和生命。因此发现新的敏感和特异性的胰腺癌诊断模式进行早期肿瘤的筛查，发现新的有效的治疗性分子靶点，成为当前胰腺癌研究的热点之一。 胰液是用于鉴定胰腺癌标志物的理想标本，是最能反映胰腺蛋白质组变化特征的体液，可以定量检测胰液中的蛋白变化，然而因为胰液不易获取，相关研究并不多见。目前还没有对胰液中游离肽组研究的报道，我们进行了一些探索性研究，对胰液标本进行简单处理后立即进行质谱分析，获得了肿瘤和正常胰液中差异表达的肽段图谱，通过PMF分析，提出了一个胰腺癌的诊断模式，通过MALDITOF/TOFMS分析，一个胰腺癌胰液相关的肽段鉴定为fibrinogenα链前体。 本文从三个方面分别探讨了体液肽表达谱分析技术平台的建立，以及基于质谱的肽表达谱分析技术在胰腺癌研究中的探索应用等问题。 第一部分：基于质谱的肽表达谱分析技术平台的建立目的：建立适用于血清、血浆、胰液、尿液等多种体液的肽表达谱分析技术平台。 方法：通过对多种样品的预处理实验，肽段提取方法进行了优化，对数据的生物信息学分析进行了标准化处理，建立了一套较为完备的基于质谱的肽表达谱分析实验方案。 结果：建立适用于血清、血浆、胰液、尿液等多种体液的肽表达谱分析技术体系，此分析技术经济、易于自动化，获得的数据质量很高，操作的重复性也很好，允许了体液中潜在的肽段/蛋白标志物的快速扫描，具有高通量、可重复性高等优点。 结论：通过对肽表达谱分析技术各步骤的实验探讨和优化，建立起适用于分析血清、血浆、胰液、尿液等多种体液的肽表达谱分析技术平台，为进一步应用于胰腺癌诊断研究奠定了基础。 第二部分：进行胰液的差异肽表达谱分析目的：构建能区分正常对照和胰腺癌的胰液差异肽表达谱。 方法：通过对胰液进行基于质谱的肽表达谱分析，获得了胰液的差异肽表达谱，通过对数据进行处理，提出能用于临床的诊断模式。 结果：通过数据分析，获得54个差异表达肽段，从中选出6个最差异显著的指标，其中两个在胰腺癌中表达上调，4个表达下调，将这些差异表达肽段组合，提出了一个诊断模式。一个胰腺癌胰液相关的肽段鉴定为fibringenα链前体。 结论：基于质谱的体液肽表达谱分析技术在胰腺癌早期诊断研究中是一种有效的方法。胰液差异肽表达谱及提出的诊断模式可为今后开展疾病相关的体液差异肽表达谱研究提供技术支持。 第三部分：利用生物信息学方法对提出的诊断模式进行评估目的：对提出的胰腺癌早期诊断模式进行评估分析。 方法：通过进行系统聚类分析、热图分析、受试者工作特征曲线(ROC)分析、主分量分析(PCA)，对提出的诊断模式进行全面深入的评估分析。 结果：系统聚类分析、热图分析、能够把样品明显的区分为正常和疾病两种状态；肿瘤中表达上调和下调的指标用主分量分析评估后准确率超过85％；潜在的胰腺癌标志物通过ROC分析，其敏感度和特异性分别为100％和82.35％。 结论：提出的胰腺癌早期诊断模式具有一定的推广应用价值，经过技术优化和临床实验后，有望用于胰腺癌的早期诊断和药物靶点研究。