风险投资作为一种创新成果，是一种针对风险企业而言的专家管理型资本的投资行为，是为风险企业尤其是高科技企业提供资本支持，并通过资本经营服务对所投资企业进行培育和辅导，在企业发育成长成熟后即退出投资以实现自身资本增值的一种特定形态的金融资本。风险投资有利于中小企业特别是高新技术企业的发展，有助于整个国家的科学技术创新，而风险投资的发展取决于风险投资机构，其组织模式与治理结构又关系到风险投资机构的运作效率。所以风险投资机构的组织模式及其治理效率问题就显得格外重要。我国从上个世纪80年代就开始了风险投资的发展，以促进我国高科技企业的成长，但一个不争的事实是我国风险投资的发展比较缓慢。基于这个现实，本文基于交易费用的视角，建立风险投资机构组织模式运作绩效评价指标体系，对不同组织模式的治理绩效进行研究。本文首先论述了目前国际上主流的几种风险投资组织模式及其运作特征，接着根据交易费用理论，对风险投资机构运作过程中产生交易费用的因素进行分析，为风险投资组织模式运作绩效评价指标体系的建立奠定基础。接着以美国有限合伙制的良好运作为范例，分析其激励相容性和运营成本，以及背后所依托的社会和法律环境，对我们所建立的指标评价体系进行验证。最后，依据我们所建立的指标体系对我国风险投资组织最优模式的选择进行分析和评价，找出其运作效率低下的原因，依据我国国情提出相关政策建议。