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目的：Apelin是G蛋白偶联受体APJ的内源性配体，人源Apelin是由APLN基因编码的，Apelin-APJ系统具有调节心血管功能、维持体液稳态和调节胰岛素分泌平衡等多种生物功能。本课题运用生物信息学方法预测Apelin基因内含子编码的microRNA（miRNA），并对其功能进行注释。方法：1. miRNAs前体预测：利用SVMbagging集成分类器预测Apelin基因内含子序列编码的pre-miRNAs；2. miRNA成熟体预测：利用MatureBayes方法预测pre-miRNAs的成熟miRNAs；3. miRNAs同源性分析：利用BLAST对已知人源miRNA前体、成熟体序列比对分析；4. miRNA靶标预测：使用PITA程序预测miRNAs的靶标；5. miRNA功能注释：运用DAVID在线分析软件对miRNA功能及信号通路进行分析；运用STRING在线软件分析miRNA靶基因编码蛋白的相互作用。结果：1.前体预测结果显示，位于Apelin基因内含子1（Intron1）的279-360nt序列编码长度为82nt的pre-miRNA；2.成熟体预测结果显示，pre-miRNA形成两条成熟miRNAs，分别命名为miR-apl-3p: GAGGCGGGGGACATGCCCGCTC和miR-apl-5p: CGCGUGUCCCACGCCCUGCACC；3. BLAST结果显示，预测的pre-miRNA与hsa-mir-3960，hsa-mir-3648序列部分同源，miR-apl-5p与hsa-miR-4674，hsa-miR-202-3p序列部分同源，miR-apl-3p与hsa-miR-940序列部分同源；4. PITA预测结果显示，miR-apl-5p有GAB2, DBF4B, NTN1等99个靶基因，miR-apl-3p有SLC25A1, COMTD1, KIF21B等676个靶基因；5. DAVID分析结果显示，miR-apl-5p的靶基因涉及骨骼系统、神经系统、管腔以及淋巴器官的发育以及骨化等生物过程；miR-apl-3p的靶基因涉及细胞形态、细胞骨架、细胞运动及细胞分化等细胞基本功能，转录调控、蛋白磷酸化调控等调控过程，骨化，骨骼发育等骨骼系统功能，涉及突触传递、轴突导向、神经因子发生等神经系统功能，吞噬作用、B细胞等免疫系统功能，参与趋化因子、VEGF（Vascular Endothelial Growth Factor），GnRH（Gonadotropin-ReleasingHormone）等受体信号通路，还与甲状腺癌和肺癌等癌症相关联。STRING结果显示，仅BCL2L2和BCL2L11，KLC1和IFT172，BMP7和IGFBP5等少数miR-apl-5p靶基因编码的蛋白间存在相互作用，而miR-apl-3p靶基因编码的蛋白间普遍存在相互作用。结论:1.预测Apelin基因内含子编码全新的miRNAs，分别命名为miR-apl-5p和miR-apl-3p；2. miR-apl-5p和miR-apl-3p的靶基因富集在Apelin功能相关的骨骼、神经、免疫系统功能，还涉及细胞骨架、细胞分化、突触传递、转录调控等众多生物学过程，还与甲状腺癌与肺癌发生相关。