WTO《农业协定》的基本精神是规范绿箱补贴,削减黄箱补贴,取消蓝箱补贴。结合国际中小型农田水利补贴发展历程,可以看到,当今世界更注重对“绿箱政策”的适用。同时注意到《农业协定》对发展中国家的优惠措施,就是允许比发达国家比例更高的黄箱补贴。我国中小型农田水利补贴政策发展的方向是加大对“绿箱政策”的适用,充分利用“黄箱政策”。自然灾害的频繁发生、气候的剧烈变化、全球性的粮食危机和农业的基础地位等要求我国要重视中小型农田水利建设,加大补贴力度,发挥政府在提供公共产品中的主导作用。2011年中央一号文件显示出我国政府对中小型农田水利的高度重视,将掀起我国农田水利建设的高峰。我国中小型农田水利补贴主要包括融资补贴、管理补贴、科技补贴和环保补贴四个方面,本文也主要从这四个方面,依据《农业协定》的相关规定,结合国内外成功经验,着重论述我国如何形成有效健全的补贴运行机制,将补贴制度规范化、法律化、长期化。本论文共包括6部分内容。第一部分引言,首先介绍问题提出的背景,然后讲述选题意义,其次说明分析研究的思路、内容和方法,最后指出研究的创新点和不足；第二部分中小型农田水利补贴的界定,中小型农田水利补贴属于农业补贴的范畴,首先提出农业补贴的相关理论依据和理论研究界对农业补贴的理解,然后详细介绍WTO《农业协定》对农业补贴的规定,最后介绍《农业协定》与中小型农田水利补贴；第三部分新中国成立以来我国中小型农田水利补贴政策的演变；第四部分中小型农田水利设补贴的主要领域分析,这是论文的主要部分之一,首先分析中小型农田水利的融资补贴,其次分析中小型农田水利设施的管理补贴,然后分析节水灌溉技术补贴机制的构建,最后分析我国中小型农田水利环境补贴机制的构建；第五部分中外中小型农田水利补贴的比较。首先介绍中小型农田水利补贴的国际背景,其次介绍国外总体上的补贴经验,然后重点介绍美国、日本和欧盟等发达国家中小型农田水利补贴的成功经验,最后比较中外中小型农田水利补贴政策；第六部分完善中小型农田水利设施补贴的思路和对策。