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瓜类细菌性果斑病是发生在葫芦科作物上的一种严重的世界性病害,其病原为西瓜嗜酸菌(Acidovorax citrulli)。该病可侵染多种葫芦科作物并在世界多国和我国多个省份发生,给当地的西甜瓜种植业造成了严重的经济损失。瓜类细菌性果斑病菌存在丰富的遗传多样性,为抗病品种的筛选增加了困难,本论文用脉冲场凝胶电泳(Pulsed Field Gel Electrophoresis, PFGE)和多位点序列分型(Multilocus Sequence Typing, MLST)两种方法研究了118株国内外瓜类果斑病菌的种内遗传多样性,主要获得以下结论:(1) PFGE多态性电泳图谱表明118株菌共呈现出19条条带,大小在200~2000 kb之间,所有菌株归结为9种条带类型。Ntsys 2.1分析,所有菌株分为两个亚群,亚群1有73个菌株,其中67株分离自甜瓜;亚群2有45个菌株,其中42株分离自西瓜。即亚群1主要是分离自甜瓜的菌株,亚群2主要是分离自西瓜的菌株,表明果斑病菌在寄主上存在明显的遗传分化。112株中国菌株中,71株属于亚群1,其中64株是我国内蒙古和新疆的菌株;41株属于亚群2,包括我国多个省份的菌株,没有形成优势地理来源。美国的典型菌株Fc247和美国菌株Fc520归属于亚群1,其他4株国外菌株都归属于亚群2。PFGE分型技术结果容易判断、重复性好,独具对大片段DNA分子的分型能力,结果较准确。(2)利用7个看家基因adk、gltA、glyA、pilT、spi、ugpB、glnA对果斑病菌进行MLST研究表明118个菌株共形成73个序列型(sequence type, ST),程序eBURST V3分析,所有菌株分成了3个群:亚群1(group 1)、亚群2(group 2)和1个单一群(singleton)。亚群1包括53个ST,共82个菌株;亚群2包括19个ST,共35个菌株。从寄主来看,亚群1的82个菌株中有甜瓜菌株68株、西瓜菌株14株;亚群2的35个菌株中有甜瓜菌株2株、西瓜菌株33株;美国的西瓜菌株Fc380成为1个单一群(singleton)。该结论与PFGE结果比较吻合,即亚群1主要是分离自甜瓜的菌株,亚群2主要是分离自西瓜的菌株。不同的是,北京的10个西瓜菌株分在了亚群1,可能说明这10个菌株与甜瓜菌株的亲缘关系较近。从地理来源看,亚群1的核心型ST45包括3个菌株,都来自我国新疆,推测亚群1的其他菌株与新疆的菌株关系更密切。亚群2的核心型ST5包括11个菌株,来自我国北京、新疆、海南、黑龙江和台湾,可见亚群2的菌株在我国的地理分布较分散。美国的典型菌株Fc247和美国菌株Fc520归属于亚群1,印度、美国、日本的菌株Fc356、Fc376、Fc491归属于亚群2,美国菌株Fc380成为1个单一群。MLST数据可以提交到官方网站http://www.mlst.net/,方便后续研究,该方法分辨率高,为该病害的流行学研究提供了重要数据。