长江水运具有占地省、运量大、能耗低、成本少、污染小等特点和优势，是我国东中西部的水运大通道。建设长江黄金水道是贯彻落实科学发展观，建设资源节约型、环境友好型社会的重要举措。长江集装箱运输作为一种先进的专业化运输方式，近二十年来发展迅猛，已成为长江航运的一个亮点。它在保障外贸和国内运输需求，促进沿江经济发展方面起着至关重要的作用。在西部开发的指引下，长江上游经济呈现强势发展，外贸货物运输量随之增长，尤其在中国加入WTO的刺激作用下，长江沿岸经济和集装箱运输将得到突飞猛进的发展；2005年12月洋山港的开港上海洋山深水港正式开港，极大的提升了黄金水道在国际航运竞争中的作用；促进中部地区崛起的发展战略，给中部六省的内外贸发展带来了前所未有的机遇。所有这些转变，都对武汉到上海的集装箱运输方式提出了新的挑战，为了促进和形成长江流域经济的联动发展，最终推动东、中、西部经济共同进步，寻求最经济合理的武汉到上海水路集装箱运输方案，成了至关重要的问题。运输决策是一项重大而复杂的系统工程，关系到很多部门的生产运作。本文通过对当前航运环境和长江经济带相关省市得发展状况的全面分析，对规划年长江经济带相关省市集装箱运量进行了预测，在预测中采用各港口之间的交流量——OD量作为基础数据预测，反映各个港口之间集装箱运输的有向关系，将四阶段法运用到集装箱运输网络中，建立了以内河、公路网、铁路轨道为主的集装箱运输网络，以集装箱船舶(水运)、集装箱卡车(公路)、集装箱列车(铁路)作为运输网络中的运输方式，集装箱及其中的货物整体作为货物单元，进而进行生成、分布及方式划分预测。对武汉——南京——洋山、武汉——外高桥——洋山和武汉——洋山江海直达三方案进行了比选，得出武汉到洋山江海直达为最佳选择的结论。最后对此方案在当前形势的实施提出了加强与武汉港与上海港的合作、建设EDI电子数据交换系统、提高武汉通关效率、开发标准船型等建议，供有关方面参考，促进长江汉申段集装箱运输的发展。